科研产出
猪瘟病毒PCR-ELISA检测方法的初步应用
《家畜生态学报 》 2023 北大核心
摘要：猪瘟(classical swine fever,CSF)是危害猪健康的重要传染病之一,具有急性、热性和高度接触性等特性,给世界养猪业造成了巨大的经济损失.PCR-ELISA 检测方法是在PCR和 ELISA 基础上创新的一种新技术,其灵敏性和准确性都高于单纯的 PCR 检测和ELISA检测.根据GenBank中猪瘟石门株序列,设计特异性引物,分别在 5'端标记生物素和地高辛,经过PCR扩增后,加入到包被有链霉亲和素的ELISA反应板上,然后通过DIG-HRP抗体进行显色反应,建立PCR-ELISA检测方法.结果表明:PCR-ELISA 最低检测到 1.81×104 拷贝/μL,普通 PCR 最低检测到 1.81×106 拷贝/μL,因此 PCR-ELISA 灵敏性比普通PCR高约 100 倍;对 27 份未知样品进行检测,普通 PCR 检测出阳性样品 15 份,阳性率为55.5%,PCR-ELISA检出 20 份阳性样品,阴性 7 份,阳性率为 74%,阳性检出率增加 18.5%;用建立的Real-Time PCR进行验证,检测结果与 PCR-ELISA 一致,两者的符合度为 100%;然后用PK15 细胞对普通PCR 未检测出的阳性样品进行病毒分离培养,通过间接免疫荧光(IFA)及普通PCR检测,结果显示该 5 份样品均为阳性.说明本研究所建立的 PCR-ELISA方法具有灵敏、特异、准确、快速、安全等优势,可应用于 CSFV 的快速诊断,为 CSFV 的流行病学监测提供有力保障.
关键词： 猪瘟病毒 PCR-ELISA 荧光定量PCR 间接免疫荧光
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玉米亲本自交系及杂交种机械粒收质量相关指标分析
《河南农业科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：以玉米亲本自交系及杂交种为试验材料，于2019—2020年对玉米植株地上倒3—5节的折断力、节间长、节间粗及收获时籽粒含水率、破碎率、抗压能力、脱水速率等指标进行分析，并筛选茎秆强度强、籽粒机收质量好的玉米材料，为适宜机械粒收玉米新种质的培育奠定基础。结果表明，自交系E8501和杂交种郑单6122的茎秆折断力较大，自交系郑58、ZC1456和杂交种郑单958折断力较小；自交系郑682和杂交种先玉335的节间较长，自交系郑588和杂交种郑单1002的节间较短；自交系郑P6、PH6WC和杂交种DK517节间较粗，自交系郑682和杂交种郑单6098节间较细。聚类分析结果表明，玉米亲本自交系E8501、郑7541、郑H71、郑V89M、郑D58M、HCL1645和PH4CV及杂交种郑单6386、郑单6122、DK517、郑单6095、郑单6098、郑单1868和郑单1002的茎秆强度较强。杂交种郑单958的籽粒含水率较高，郑单6122较低；自交系郑H71和杂交种郑单958、郑单1868的籽粒破碎率较高，自交系PH4CV和杂交种DK517的籽粒破碎率较低；自交系PH4CV和杂交种郑单6122的籽粒抗压能力较大，自交系郑H71和杂交种郑单958的籽粒抗压能力较小。玉米收获时籽粒含水率≤26.87%就能够满足籽粒破碎率≤5%的机械粒收标准。在上述14个抗倒伏能力较强的玉米材料基础上，最终筛选出亲本自交系E8501、郑7541、郑H71、郑V89M、郑D58M、HCL1645和PH4CV以及杂交种DK517、郑单6122、郑单6386和郑单6098为抗倒伏较强且机械粒收质量佳（籽粒含水率≤26.87%且破碎率≤5%）的材料。
关键词： 玉米 机械粒收 折断力 节间长 节间粗 含水率 破碎率 抗压能力 脱水速率
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南美白对虾中短波红外干燥特性及模型拟合
《食品安全质量检测学报 》 2023 北大核心
摘要：目的 研究南美白对虾中短波红外干燥（medium-short-wave infrared drying, MSWID）特性及其干燥模型拟合。方法 在不同温度下（50、60、70℃）对南美白对虾进行干燥试验,并以热风干燥（hot air drying, HAD）为对比。采用8种常用干燥模型对试验数据进行非线性回归拟合,确定最佳干燥模型,并对干燥模型进行验证。并进一步分析不同温度下南美白对虾有效水分扩散系数和干燥活化能。结果 南美白对虾MSWID过程中,干燥温度对干燥过程影响显著,提高干燥温度可提高干燥速率,加快干燥进程。比较模型评价指标发现,Two-term exponential模型可以很好的拟合南美白对虾干燥数据,模型预测值和试验值误差仅为2.09%,可较准确的预测干燥过程中南美白对虾的水分变化规律。二阶多项式回归方程可预测水分比随干燥温度和时间的变化。随着干燥温度的升高,MSWID和热风干燥的有效水分扩散系数分别从2.3721×10-9 m~2/s、2.3027×10-9 m~2/s升高到3.4027×10-9 m~2/s和3.1794×10-9 m~2/s,活化能分别为16.5703 kJ/mol和14.7839 kJ/mol。结论 MSWID干燥时间更短,干燥速率更快。Two-term exponential模型可真实、准确地描述MSWID和HAD下南美白对虾的干燥过程。本研究可为南美白对虾MSWID干燥过程的预测和控制提供理论依据。
关键词： 南美白对虾 中短波红外干燥 干燥特性 干燥模型 有效水分扩散系数
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玉米农艺性状配合力全基因组关联分析和预测
《核农学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：一般配合力（GCA）是评价亲本自交系利用价值的一个重要指标。为解析玉米配合力遗传机理，以NCII遗传交配设计获得的537份杂交组合为材料，结合玉米5.5K液相育种芯片的11 734个高质量单核苷酸多态性（SNP）标记，采用7种多位点全基因组关联分析（MGWAS）方法挖掘新乡、周口和综合环境穗行数、粒长和粒宽GCA显著关联位点，并在MGWAS研究基础上利用5种基因组选择方法对GCA效应开展预测研究。结果表明，共检测到46个SNPs与穗行数以及2个籽粒性状GCA显著关联（P＜8.52×10-7），其中10个位点被2～5种MGWAS方法同时检测到，8个SNPs被至少2个环境共定位。6个SNPs（1＿43440622、2＿69742504、2＿71037706、2＿197716855、5＿219239213和8＿134634317）为环境稳定和MGWAS方法稳定重叠的位点，是控制穗行数和籽粒性状GCA效应的重要位点。穗行数和粒宽GCA利用5种随机效应模型取得较高的预测准确性，为0.62～0.74，粒长GCA基因组预测精度较低，为0.28～0.45。3个环境中，多数情况下将不同MGWAS挖掘的显著SNPs作为固定效应加入最佳线性无偏估预测（GBLUP）和再生核希尔伯特空间（RKHS）会提高穗行数和2个籽粒性状GCA的预测准确性，穗行数和粒宽的提高率为0.66%～15.96%，粒长的提高率为9.26%～83.05%。本研究结果为后续基因功能验证以及关键位点的基因组选择辅助育种提供了重要基因信息和技术指导。
关键词： 一般配合力 多位点全基因组关联分析 基因组选择
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红花CtANR2和CtANR3基因的克隆、结构及表达模式分析
《华北农学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：原花青素是植物中广泛存在的一类黄酮类化合物，是人类膳食的重要营养成分，在防治病虫害方面也发挥着重要作用，花青素还原酶（ANR）是合成原花青素的关键酶。以大果球红花品种为材料，克隆得到2个CtANR基因。生物信息学分析表明，CtANR2和CtANR3的编码区分别为1 020,1 023 bp,对应基因组序列中均含有5个外显子和4个内含子，第1个外显子长度不同，其余4个外显子长度一致，内含子长度差异较大。CtANR2和CtANR3基因编码蛋白质的氨基酸数目分别为339,340个，二级结构都主要由α-螺旋和无规则卷曲构成，都属于水溶性蛋白，但CtANR2蛋白不稳定，而CtANR3为稳定的亲水性蛋白。此外，2个蛋白质都不存在信号肽和跨膜结构，可能定位于细胞外。序列比对及系统进化分析表明，CtANR2和CtANR1同源性最高，亲缘关系最近，3个CtANR蛋白与菊科植物ANR蛋白进化关系最近，与茄科、锦葵科和桑科植物ANR蛋白也同属一个大分支。组织特异性表达分析发现，CtANR2和CtANR1组织表达模式相似，都是在花中的表达量最高，初期果球表达量最低，而CtANR3则在苞片中表达量最高，根和初期果球中表达量最低。三者在不同激素胁迫下呈现出不同的表达模式，CtANR2和CtANR1在不同激素处理后表达量均下降，而CtANR3在5种激素处理后表达量均有不同程度的升高。以上结果表明，红花3个CtANR基因可能在红花不同发育阶段及抵抗非生物胁迫中有不同的分工。
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小麦硝酸盐转运蛋白基因TaNRT1.1的鉴定及其等位变异分析
《麦类作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为解析小麦硝酸盐转运蛋白基因 TaNRT1.1的生物学功能，本研究通过同源克隆的方法从普通小麦中克隆了小麦硝酸盐转运蛋白基因 TaNRT1.1（TaNRT1.1-1A、 TaNRT1.1-1B和 TaNRT1.1-1D）。生物信息学分析表明，这三个同源基因编码的蛋白均为疏水蛋白，含有丰富的α-螺旋和无未见则卷曲，主要定位于质膜上。小麦不同组织qRT-PCR分析表明， TaNRT1.1-1A和 TaNRT1.1-1B基因在根中表达量最高，其次是叶和茎， TaNRT1.1-1D基因在茎中表达量最高，其次是叶和根。因此，推测 TaNRT1.1-1A和 TaNRT1.1-1B基因在硝酸盐吸收过程中发挥了重要作用， TaNRT1.1-1D基因在硝酸盐转运过程中发挥了重要作用。通过对小麦 TaNRT1.1基因多态性筛选发现，在 TaNRT1.1-1A基因启动子上游1 120 bp的位置有一个8 bp（TGCATGCA）的插入位点，该位点可能与小麦氮利用效率相关。不同氮利用效率小麦品种qRT-PCR分析结果表明，氮高效小麦品种（基因型为 TaNRT1.1-1A-b）苗期根中 TaNRT1.1-1A基因的相对表达量显著高于氮低效小麦品种（基因型为 TaNRT1.1-1A-a）。
关键词： 小麦 硝酸盐转运蛋白 TaNRT1.1基因 生物信息学 表达分析
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微光环境下草地贪夜蛾的颜色视觉行为反应
《植物保护 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：夜出型昆虫与日出型昆虫一样,具有强大的颜色视觉能力.为明确微光环境下草地贪夜蛾的颜色视觉行为反应,本研究利用颜色卡纸测试了草地贪夜蛾对紫色、蓝色、绿色、黄色和红色等5种颜色的趋向、取食和产卵选择的偏好性.结果表明,趋向测试中,草地贪夜蛾雌雄成虫对蓝色(21.43%和18.57%)和紫色(17.13%和15.70%)表现出明显的趋性,显著高于绿色、黄色和红色;取食测试中,其成虫对不同颜色的选择率无明显差异;产卵选择则明显偏好黄色(40.27%)和绿色(40.17%).本研究在理论上丰富了昆虫微光视觉生态学理论,也为深入研究草地贪夜蛾颜色视觉行为机理提供了基础,应用上为利用颜色视觉研发草地贪夜蛾物理防控措施提供了科学依据.
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一种新的广适性大白菜杂交种纯度分子鉴定方法的研究
《中国瓜菜 》 2023 北大核心
摘要：以往进行大白菜杂交种分子纯度鉴定,需要基于亲本开发相应的分子标记,有基因型依赖性。笔者以大白菜杂交种基因组DNA为模板,分别基于自交不亲和S单元型多态性开发的BrCⅠ引物、BrCⅡ引物进行PCR扩增,根据扩增产物的电泳结果确定该大白菜商品杂交种纯度;当杂交种亲本分别为Ⅰ类S单元型和Ⅱ类S单元型时,筛选以BrCⅠ和BrCⅡ引物分别扩增后的产物中只有一个出现条带的材料即为假杂种;当亲本同时为Ⅰ类S单元型或Ⅱ类S单元型时,用限制性内切酶Hinf I或Alu I对PCR产物进行酶切,筛选酶切产物中电泳条带的带型显著不一致的材料为假杂种。该方法为一种新的广适性大白菜杂交种纯度分子鉴定方法,利用该方法进行纯度鉴定,整个周期只需2～3 d,快速精准。
关键词： 大白菜 S单元型 广适性 分子标记 纯度鉴定 酶切
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