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白羽肉鸡小肠内容物中致病性大肠杆菌的鉴定及基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李明 1 ; 崔洪伟 1 ; 高婕 1 ; 安乐乐 1 ; 李松励 1 ; 饶正华 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,中心实验室

关键词： 白羽肉鸡;肠道;致病菌;宏基因组测序;菌群结构

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2024 年 06 期

页码： 2692-2700

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在分析死亡白羽肉鸡肠道中的致病微生物，明确白羽肉鸡的死因，为白羽肉鸡的科学防病和治病提供新思路。采集养鸡场病死白羽肉鸡的肠道内容物，利用宏基因组测序、序列拼接、分箱技术、进化树分析、物种注释鉴定白羽肉鸡肠道中的致病微生物，通过基因组毒力基因和耐药基因的注释，阐述病原微生物的致病和耐药机制。结果显示：病死白羽肉鸡肠道内容物样品中检出的致病微生物为禽类致病性大肠杆菌(avian pathogenic Escherichia coli),经序列拼接和分箱技术得到病原菌全基因组序列，大小为4 998 208 bp,完整度为99.23%。该菌含有毒力基因192种，主要编码鞭毛、纤毛合成相关蛋白、定植相关蛋白、菌素合成相关蛋白，含有耐药基因88种，主要涉及28类抗生素的耐药，表明上述种类抗生素对感染禽类致病性大肠杆菌的白羽肉鸡无治疗作用，最终导致白玉肉鸡死亡。本研究利用宏基因测序技术可有效分析白羽肉鸡的致病微生物及致病、耐药机制，可在白羽肉鸡发病早期帮助养殖者了解病因，并有针对性地指导科学用药，减少经济损失。

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