文献类型： 中文期刊
作者： 师志海 1 ; 王文佳 1 ; 王亚州 1 ; 张彬 1 ; 邓廷贤 1 ;
作者机构： 1.河南省农业科学院畜牧兽医研究所;河南牧业经济学院动物医药学院;广西壮族自治区水牛研究所
关键词： 奶牛;乳腺上皮细胞;三代测序;转录组
期刊名称： 中国畜牧杂志
ISSN： 0258-7033
年卷期： 2023 年 59 卷 012 期
页码： 271-276
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 本研究旨在表征奶牛乳腺上皮细胞的转录组特性,为基于乳腺上皮细胞的功能基因组学研究提供参考依据.体外培养奶牛乳腺上皮细胞系(MAC-T),用Nanopre Direct RNA Sequencing(DRS)技术进行了三代转录组测序分析,结合生物信息手段分析转录表达、RNA甲基化修饰和选择性剪切等生物学特征.结果发现,在乳腺上皮细胞中共组装到 55 140 个转录本,其中已知转录本 51 379 个,新发现的转录本 3 761 个.多聚腺苷酸A[poly(A)]分析显示,转录本的表达量与poly(A)尾巴长度呈显著负相关(P<0.0001).在MEC1和MEC3 样本中分别检测到 6 853 个和 6 343 个剪切事件,其中剪切事件发生次数最多的前 3 位是SE、A5 和A3.RNA甲基化修饰检测发现,乳腺上皮细胞中m5C位点数高于m6A位点数,其中这些修饰位点主要分布于CDS区域,其次是 5'UTR和 3'UTR.本研究表征了乳腺上皮细胞转录本、ploy(A)尾巴长度、可变剪切和RNA甲基化修饰等生物学特性,将为乳腺上皮细胞模型的功能基因组学研究提供有效支撑.
- 相关文献
[1]转录组测序技术的研究和应用进展. 崔凯,吴伟伟,刁其玉. 2019
[2]奶牛原代乳腺上皮细胞的培养及β酪蛋白mRNA的表达. 蒲俊华,朱小瑞,绪欣,卢徐斌,毛永江,杨章平. 2017
[3]荷斯坦奶牛乳腺组织冻存及乳腺上皮细胞原代培养技术改进. 林杰,王旭荣,王磊,张景艳,王学智,孟嘉仁,杨志强,李建喜. 2016
[4]奶牛乳腺上皮细胞原代培养、纯化及鉴定技术研究进展. 林杰,王旭荣,李建喜,王孝武,杨志强. 2015
[5]金黄色葡萄球菌处理对奶牛乳腺上皮细胞外泌体表征的影响. 蔡萌,朱晓艳,王梦玲,刘子豪,熊本海,杨亮. 2022
[6]大豆异黄酮在奶牛生产中的研究进展. 赵悦,童津津,熊本海,蒋林树. 2019
[7]不同方法分离奶牛乳腺上皮细胞体外培养的研究. 王治国,王传蓉,王加启. 2009
[8]采食高淀粉高油日粮奶牛的泌乳性能、乳成分变化及乳腺差异表达基因筛选. 吴柯,韩印如,李斌,刘肃然,贾坤,毕研亮,刘德武,郭勇庆. 2024
[9]三代测序和单细胞转录组测序技术在家畜雄性生殖领域的研究进展. 王兴东,郭宪. 2024
[10]精氨酸水平对奶牛乳腺上皮细胞体外生长及κ-酪蛋白基因表达的影响. 徐柏林,王梦芝,张兴夫,哈斯,王春艳,敖长金,王洪荣. 2012
[11]水牛乳汁中乳腺上皮细胞的分离培养及鉴定. 段安琴,庞春英,朱鹏,邓廷贤,陆杏蓉,马小娅,梁莎莎,梁贤威. 2017
[12]水牛原代体细胞慢病毒感染体系的建立. 段安琴,陆杏蓉,马小娅,梁莎莎,庞春英,梁贤威,邓廷贤. 2019
[13]DDR1基因过表达对水牛乳腺上皮细胞的影响. 陆杏蓉,段安琴,马小娅,梁莎莎,庞春英,梁贤威,邓廷贤. 2019
[14]脂多糖对泌乳奶牛乳中氨基酸组成及蛋白质代谢相关基因表达的影响. 臧长江,张养东,王加启,胡涛,卜登攀,金迪,周凌云,李发弟. 2012
[15]不同浓度胰岛素样生长因子-I对体外培养奶牛乳腺上皮细胞乳蛋白和脂肪合成相关基因表达的影响. 王皓宇,秦彤,郝海生,杜卫华,赵学明,朱化彬. 2013
[16]体外激素处理对奶牛乳腺上皮细胞FcRnmRNA表达的影响. 张春林,王加启,胡小丽,赵圣国,章玉涛,卜登攀,周凌云. 2010
[17]不同浓度胰岛素样生长因子-Ⅰ对体外培养奶牛乳腺上皮细胞乳蛋白和脂肪合成相关基因表达的影响. 王皓宇,秦彤,郝海生,杜卫华,赵学明,朱化彬. 2013
[18]胰岛素对体外培养奶牛乳腺上皮细胞乳蛋白、乳脂肪合成相关基因mRNA表达的影响. 王皓宇,秦彤,郝海生,杜卫华,赵学明,朱化彬. 2013
[19]哺乳动物乳腺上皮细胞体外培养研究进展. 张燕,杜卫华,郝海生,赵学明,王栋,秦彤,刘岩,朱化彬. 2011
[20]LPIN1基因对水牛乳腺上皮细胞甘油三酯和脂肪酸合成的影响. 段安琴,陆杏蓉,马小娅,梁莎莎,邓廷贤. 2020
作者其他论文 更多>>
-
运动营养食品分类、适用场景及发展前景
作者：李文欣;张彬;冯丽萍;韩芸娇
关键词：运动营养食品;体育锻炼;发展
-
基于代谢组学的功能性食品营养干预路径研究
作者：韩芸娇;冯丽萍;张彬
关键词：代谢组学;功能性食品;营养干预;公众健康
-
谷子抽穗期基因SiGI的表达与单倍型变异分析
作者：姚琦;智慧;孟强;袁迪;张彬;刁现民;贾冠清
关键词：全基因组关联分析;单倍型分析;节律性表达;抽穗期;谷子
-
N1亚型猪流感病毒荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用
作者：张傲;王佳慧;王文佳;谭斌;张淑琴
关键词：猪流感病毒;N1亚型;实时荧光定量PCR;鉴别诊断
-
水牛DDR1基因生物信息学及细胞学功能分析
作者：陆杏蓉;段安琴;邓廷贤;马小娅;杨春艳;郑海英;冯超;黄晨茜;尚江华
关键词：DDR1基因;生物信息学;分析;乳腺上皮细胞;增殖;凋亡;迁移
-
河流型水牛犊牛初生重影响因素分析
作者：韦科龙;卢瑛;钟华配;文崇利;梁淦;黄才斌;邓廷贤
关键词：河流型水牛;犊牛;初生重;因素分析
-
河流型水牛LPL基因在不同组织及泌乳期的表达水平分析
作者：梁莎莎;庞春英;邓廷贤;陆杏蓉;段安琴;马小娅;梁贤威
关键词：水牛;脂蛋白分解酶;基因克隆;组织表达;泌乳期表达
