文献类型： 中文期刊

作者： 陆杏蓉 ¹ ; 段安琴 ¹ ; 邓廷贤 ¹ ; 马小娅 ¹ ; 杨春艳 ¹ ; 郑海英 ¹ ; 冯超 ¹ ; 黄晨茜 ¹ ; 尚江华 ¹ ;

作者机构： 1.中国农业科学院广西水牛研究所农业农村部水牛遗传繁育技术重点实验室/广西水牛遗传繁育重点实验室

关键词： DDR1基因;生物信息学;分析;乳腺上皮细胞;增殖;凋亡;迁移

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2023 年 009 期

页码： 48-53,130-131

收录情况： 北大核心

摘要： 为了了解水牛DDR1蛋白的生物信息学和细胞学功能，试验采用ProtParam、ProtScale、SOPMA、SWISS-MODEL、PSORTⅡPredictio、NetPhos 3.1在线软件对水牛DDR1蛋白进行生物信息学分析，采用基因干扰的方法研究水牛DDR1基因对水牛乳腺上皮细胞增殖、凋亡、基因表达和迁移的影响。结果表明：水牛DDR1蛋白由915个氨基酸组成，分子式为C₄₅₃₈H₇₀₂₉N₁₂₆₁O₁₂₈₇S₄₃,分子量为101 222.99 u,半衰期为30 h,理论等电点为6.22,属于酸性、不稳定、可溶性蛋白质。DDR1蛋白的二级结构由256个α-螺旋（27.98%）、175个延伸链（19.13%）、55个β-折叠（6.01%）、429个无规则卷曲（46.89%）构成。亚细胞定位于内质网（44.4%）、高尔基体（33.3%）和质膜中（22.2%）中。DDR1蛋白共含有65个磷酸化位点，其中丝氨酸磷酸化位点35个，苏氨酸磷酸化位点18个，酪氨酸磷酸化位点12个。DDR1基因的最佳干扰片段为siDDR1-1,最佳干扰时间为48 h。DDR1基因干扰72小时时可极显著抑制水牛乳腺上皮细胞的增殖（P＜0.01）。DDR1基因干扰显著或极显著上调凋亡相关基因BCL-2（P＜0.01）、XIAP（P＜0.05）、TP53（P＜0.01）和增殖相关基因CCND1（P＜0.01）的表达，下调凋亡相关基因CASPASE3（P＜0.05）和CCDB1（P＞0.05）的表达，但对细胞凋亡率的影响不显著（P＞0.05）。此外，DDR1基因干扰可极显著降低水牛乳腺上皮细胞的迁移率（P＜0.01）。说明DDR1基因干扰可极显著影响水牛乳腺上皮细胞的增殖和迁移。