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植物复杂基因组与泛基因组研究现状与展望

文献类型： 中文期刊

作者： 王英豪 1 ; 余嘉鑫 2 ; 唐海宝 1 ; 张兴坦 2 ;

作者机构： 1.福建农林大学生命科学学院

2.中国农业科学院深圳农业基因组研究所

关键词： 植物基因组学;测序技术;组装算法;植物复杂基因组;植物泛基因组

期刊名称： 中国科学(生命科学)

ISSN： 1674-7232

年卷期： 2024 年 002 期

页码： 233-246

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 基因组是指一个生物体内遗传物质的总和,是生物学研究的关键之一.自2000年拟南芥基因组被测序发表以来,已有超过800个植物基因组相继被破解,极大促进了植物分子生物学、遗传学等领域的发展.即便如此,植物基因组学研究仍然面临一系列挑战,包括高杂合、高重复度、高倍性等复杂基因组的组装和泛基因组的构建等.本文从植物基因组学的发展概况、基因组测序技术、组装算法等三个方面,全面展示了植物基因组的快速发展.其中,介绍了简单基因组装和复杂基因组装的相关策略,总结了“端粒到端粒”（telomere-to-telomere或称T2T）的组装和泛基因组构建方法以及其重要性.最后,对未来植物基因组的发展进行了展望,认为随着技术的不断进步,基因组解析技术和方法将会更加完善,为植物基因组的深入研究提供更多支持.本文为植物T2T、复杂基因组组装和泛基因组的构建方法研究提供了参考依据.

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