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茶树GRF转录因子的比较基因组学和杂种优势

文献类型: 中文期刊

作者: 侯炳豪 1 ; 王鹏杰 1 ; 郭永春 1 ; 王丽 1 ; 谷梦雅 1 ; 张兴坦 1 ; 叶乃兴 1 ;

作者机构: 1.福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室;中国农业科学院农业基因组研究所;武夷学院茶与食品学院

关键词: 茶树;铁观音;黄棪;GRF转录因子;比较基因组;杂种优势

期刊名称: 应用与环境生物学报

ISSN: 1006-687X

年卷期: 2022 年 28 卷 006 期

页码: 1477-1484

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 生长调控因子(growth-regulation factor,GRF)是植物在调控生长发育中起重要作用的一类转录因子.利用生物信息学的方法,在铁观音、黄棪和舒茶早3个茶树基因组进行GRF基因家族的比较基因组分析,分别鉴定获得15、16和14个CsGRF基因家族成员,均具有完整的QLQ和WRC特征结构域.基于系统进化关系可将CsGRF分为6组,同一分组的基因结构与蛋白保守基序相似.CsGRF启动子上存在大量与光响应、激素响应与胁迫响应相关的顺式作用元件.不同组织转录组数据分析表明,CsGRF在茶树的幼嫩芽叶中表达量高,成熟叶和根中表达量低甚至不表达.荧光定量结果发现,铁观音CsGRF表达量明显低于黄棪的表达量;人工杂交F1代品种间CsGRF表达量存在差异,金观音CsGRF的表达量整体上稍高于母本铁观音,但不显著;黄观音CsGRF3、CsGRF7、CsGRF10、CsGRF12的表达量显著高于母本铁观音,CsGRF2、CsGRF5、CsGRF6、CsGRF14呈现超高亲表达,且CsGRF2达到显著水平;金牡丹CsGRF3和CsGRF5的表达量显著高于母本;紫玫瑰CsGRF的表达量除CsGRF6外均高于铁观音,CsGRF1、CsGRF2、CsGRF4、CsGRF5、CsGRF9和CsGRF14呈现超高亲表达,且除了CsGRF9外均达到显著水平.本研究推测部分CsGRF在杂交子代中的优势表达可能与茶树生长势杂种优势的形成有关.

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