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基于高深度基因组重测序的‘铁观音’茶树无性繁殖后代遗传变异研究

文献类型: 中文期刊

作者: 侯炳豪 1 ; 高婷 1 ; 魏月德 1 ; 高水练 1 ; 蔡银笔 1 ; 陈志明 1 ; 金珊 1 ; 张兴坦 1 ; 王鹏杰 1 ; 叶乃兴 1 ;

作者机构: 1.福建农林大学园艺学院,茶学福建省高校重点实验室;福建安溪岐山魏荫名茶有限公司;福建八马茶业有限公司;安溪县茶业发展中心;中国农业科学院农业基因组研究所

关键词: 茶树;无性繁殖;重测序;遗传变异

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2023 年 07 期

页码: 1505-1517

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 对茶树[Camelliasinensis(L.)O.Kuntze]‘铁观音’母树及其连续3代无性繁殖后代和3个经多代无性繁殖的生产茶园叶片进行超过50×的高深度基因组重测序。通过SNP和InDel检测与注释,发现大部分变异位于基因间区,只有1.09%~1.13%的SNP和0.51%~0.61%的InDel位于基因编码区。在全基因组和编码区范围内,连续3代无性繁殖后代的样本之间总变异位点数均差别不大,各样本中涉及突变的基因数基本一致,推测‘铁观音’品种的种性在无性繁殖过程中总体保持稳定。与母树间差异基因的KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集结果表明,生产茶园样本在嘌呤类和糖类代谢通路中显著富集,并在咖啡碱代谢通路中呈极显著富集,推测‘铁观音’品种在长时间无性繁殖过程中,部分与品质相关的代谢通路基因发生变化。与前3代样本相比,FAR1、WAT1和MYB等3个与生长发育相关,PP2A、BTB/POZ、BAT2、RPP13和Lr10等5个与逆境响应相关的基因序列在生产茶园样本中发生了变异。

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