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gga-miR-26a的组织特异性表达及其靶基因的预测分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李瑞瑞 1 ; 张子晓 1 ; 赵振华 1 ; 韩威 1 ; 向海 1 ; 王钱保 1 ; 黄正洋 1 ; 李春苗 1 ; 宗毅 1 ; 黄华云 1 ;

作者机构: 1.江苏省家禽科学研究所;佛山科学技术学院广东省动物分子设计与精准育种重点实验室;河北科技师范大学

关键词: gga-miR-26a;鸡;表达特性;靶基因

期刊名称: 江苏农业科学

ISSN: 1002-1302

年卷期: 2024 年 52 卷 005 期

页码: 64-69

收录情况: 北大核心

摘要: 为初步阐明gga-miR-26a在鸡脂肪沉积中的作用,以矮小品系S3系(DW)和隐性白羽鸡(RR)为试验素材,采用实时荧光定量PCR法检测gga-miR-26a在2个品种不同生长发育时期肝脏、腹脂及腿肌组织,腹脂和肌内脂肪细胞增殖期和分化期的表达变化,并利用生物信息学的方法,对gga-miR-26a靶基因进行预测和分析.结果表明,gga-miR-26a在S3系鸡(DW)和隐性白羽鸡(RR)16 W时肝脏组织中的表达存在显著的品种差异,S3系鸡在5个发育阶段表达均高于隐性白羽鸡;腹脂组织中,gga-miR-26a在0 W时存在极显著的品种差异(P<0.01)且显著高于其他周龄;gga-miR-26a在腿肌组织中的表达无显著的品种差异(P>0.05);在脂肪细胞中,gga-miR-26a在分化4 d的表达显著高于增殖期(P<0.05).利用TargetScan、miRDB、miRmap等3个软件对gga-miR-26a靶基因进行预测,共预测到163个交集靶基因;GO及KEGG分析提示gga-miR-26a可能通过靶向调节PTEN、ULK2和PRKCD的表达,进而调控鸡的脂肪沉积.综上所述,gga-miR-26a在2个品种鸡脂肪相关组织及脂肪细胞中均有表达,且具有显著的品种差异;gga-miR-26a参与了鸡的脂肪沉积过程,PTEN、ULK2和PRKCD可能是gga-miR-26a调控脂肪沉积的预测靶基因.

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