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鸡Fnip1基因克隆、组织表达及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 黄正洋 1 ; 孔令琳 1 ; 王钱保 1 ; 李春苗 1 ; 吴兆林 1 ; 黄华云 1 ; 赵振华 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院家禽研究所

关键词: 鸡;Fnip1;基因克隆;表达分析;生物信息学分析

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2025 年 41 卷 001 期

页码: 119-125

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了明确鸡卵泡素相互作用蛋白1基因(Fnip1)特征及其表达规律,本研究选择苏禽3号黄羽肉鸡为试验材料,运用分子克隆技术扩增了鸡Fnip1基因CDS区序列全长,对其序列特性进行了生物信息学分析,构建了系统进化树;利用RT-qPCR方法检测了Fnip1基因在鸡不同组织中的表达。结果获得鸡Fnip1基因CDS区,序列开放阅读框为3 474 bp,位于第13号染色体16 191 415 bp至16 251 731 bp之间,编码1 157个氨基酸。生物信息学分析结果显示,Fnip1基因有20个外显子,FNIP1蛋白含有FNIP_N、FNIP_M和FNIP_C等3个结构域;进化树显示,鸡先与鸟类聚为一类,再与哺乳动物聚为一支,在禽类上序列保守。FNIP1蛋白为亲水性蛋白,相对分子量为128 310,理论等电点为5.25。蛋白质二级结构由α-螺旋(34.40%)、β-折叠(4.06%)、延伸链(13.74%)、无规则卷曲(47.80%)组成。表达分析结果显示,Fnip1基因在鸡的胸肌和腿肌中表达量显著高于其他组织。综上所述,本研究获得了鸡Fnip1基因CDS区序列全长,发现其在鸡肌肉组织中有较高表达。本研究结果可为进一步研究Fnip1基因在鸡肌肉生长发育中的分子机制研究奠定数据支撑。

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