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棉花SRS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张雪 1 ; 孙瑞斌 1 ; 马聪聪 1 ; 马丹 1 ; 张晓睿 1 ; 刘志红 1 ; 刘传亮 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院棉花研究所

关键词： 棉花;SRS;系统进化;表达模式;基因家族

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2022 年 34 卷 002 期

页码： 107-119

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]短链相关序列(SHI-related sequence,SRS)家族是一类植物特有的转录因子,在调节植物生长发育和逆境胁迫反应中发挥重要作用.鉴定和分析棉花SRS基因家族成员.[方法]结合拟南芥相关信息,以陆地棉和海岛棉为主要研究对象,对棉花SRS基因进行全基因组鉴定和系统进化研究,并分析其在不同器官、不同发育时期的胚珠和纤维、以及在非生物胁迫下棉苗中的表达模式.[结果]在陆地棉和海岛棉中分别鉴定出27个和26个SRS基因,系统进化分析将棉花SRS基因家族成员划分为3个分支,不同分支都具有相似的保守基序.每个分支都存在多对同源基因.一些SRS基因在胚珠发育时期表达量较高,并响应多种非生物胁迫.[结论]分析预测了棉花SRS基因的家族成员进化关系与潜在功能,为棉花SRS基因的功能研究提供初步的理论基础.

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