文献类型： 中文期刊

作者： 林雨昕 ¹ ; 曹家瑄 ¹ ; 孙晖 ¹ ; 李俊 ¹ ; 李华钊 ¹ ; 吴祺鹏 ¹ ; 邓廷贤 ² ; 杨利国 ¹ ; 滑国华 ¹ ;

作者机构： 1.华中农业大学动物科技学院农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室

2.中国农业科学院广西水牛研究所广西水牛遗传繁育重点实验室

关键词： 水牛;ApoB;泌乳性状;性状关联分析;基因多态性

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2022 年 006 期

页码： 1180-1192

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究旨在探究水牛（Bubalus bubalis）载脂蛋白B基因（ApoB）在地中海水牛群体中的遗传多态性，并与地中海水牛泌乳性状进行关联分析，筛选水牛产奶性状分子标记。本研究以350头地中海纯种奶水牛为研究对象，利用直接测序法和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）法筛选基因多态性（single nucleotide polymorphisms, SNPs）与基因分型，并进一步分析单倍型与泌乳性状的相关性。结果显示，在地中海水牛群体ApoB基因中筛选到10个SNPs,分别位于启动子（g.-1718A＞G、g.-1823G＞C和g.-2063A＞C）、第7内含子（g.8105G＞A）、第26内含子（g.30643G＞A）、第5外显子（g.5903G＞A）、第26外显子（g.30879T＞C、g.33638A＞C和g.37375G＞A）和第29外显子（g.40787A＞G）区域。10个SNPs位点多态信息含量均大于0.25且小于0.5,属于中度多态。其中g.-1718A＞G、g.-1823G＞C、g.-2063A＞C、g.37375G＞A和g.40787A＞G突变位点与地中海水牛乳蛋白率显著相关，g.5903G＞A和g.40787A＞G位点与地中海水牛乳脂率显著相关，g.37375G＞A与地中海水牛270天乳蛋白量和乳脂量显著相关。单倍型Block1（g.-1718A＞G、g.-1823G＞C和g.-2063A＞C）与270天乳蛋白量和乳蛋白率显著相关；单倍型Block2（g.30643G＞A和g.33638A＞C）与270天乳脂含量、乳脂率、270天乳蛋白量以及乳蛋白率显著相关；单倍型Block3（g.37375G＞A和g.40787A＞G）与乳蛋白率显著相关；g.33638A＞C、g.37375G＞A、g.40787A＞G以及单倍型Block2和Block3突变型蛋白质理化性质和二级结构发生改变。本研究共筛选到6个SNPs和3个单倍型Block与水牛泌乳性状显著相关，其中单倍型Block2的H3H3为最优单倍型，可作为水牛产奶性状潜在分子标记。