您好,欢迎访问中国农业科学院 机构知识库!

2020-2023年甘肃猪繁殖与呼吸综合征病毒的基因遗传变异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 焦守德 1 ; 张婧 1 ; 李平花 1 ; 王健 1 ; 韩庆彦 2 ; 张雨星 1 ; 魏达礼 1 ; 王方洲 1 ; 白兴文 1 ; 卢曾军 1 ; 马雪青 1 ; 孙普 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院兰州兽医研究所兰州大学动物医学与生物安全学院动物疫病防控全国重点实验室

2.甘肃省动物疫病预防控制中心

关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒;ORF5;NSP2;ORF3;遗传变异

期刊名称: 中国兽医科学

ISSN: 1673-4696

年卷期: 2024 年 54 卷 011 期

页码: 1482-1490

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了了解甘肃地区猪群中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行及遗传变异情况,采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法对2020-2023年收集的猪组织样品进行PRRSV ORF5、NSP2和ORF3基因扩增并测序,通过MEGA软件构建遗传进化树进行遗传变异分析。结果显示,共检测了52份猪临床样品,PRRSV核酸阳性率为61.5%(32/52),成功获得了32条ORF5、15条NSP2和14条ORF3基因序列。ORF5基因遗传进化分析表明,2020—2023年甘肃地区猪群中PRRSV流行毒株中存在美洲型1.5谱系(4株)、1.8谱系(24株)、5.1谱系(2株)、8.7谱系(2株);NSP2基因遗传进化分析表明,获得的15条NSP2序列均为1.8谱系;ORF3基因遗传进化分析表明,获得的14条ORF3序列包括1.5谱系(2株)、1.8谱系(11株)、3.5谱系(1株)。基因核苷酸序列与参考毒株的同源性分别为ORF5 82.3%~99.7%、NSP2 85.9%~90.0%和ORF3 89.8%~95.7%;基因编码氨基酸序列与参考毒株的同源性分别为ORF5 79.6%~99.0%、NSP2 83.4%~87.7%和ORF3 85.1%~94.5%。ORF5基因编码的GP5蛋白的信号肽区、高变区、细胞表位区等区域均存在不同程度的变异,其中5株毒株的第33位氨基酸出现了缺失;15株NSP2蛋白氨基酸序列的缺失模式与NADC30株一致。上述结果表明,当前甘肃地区猪群中PRRSV呈现以1.8谱系毒株为优势的美洲型多谱系共循环流行,这对甘肃地区防控PRRSV提供了重要的流行病学数据。

  • 相关文献

[1]2014年~2016年某大型规模化猪场猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传演化分析. 李真,张洪亮,张晶,张文立,刘春晓,相丽润,冷超粮,彭金美,王倩,安同庆,童光志,蔡雪辉,田志军. 2017

[2]2017-2020年我国部分地区PRRSV流行毒株变异情况分析. 吴瑕,劳梦琴,谭祥梅,陈鹏飞,于家荣,朱钧锐,张玉娇,虞凌雪,高飞,姜一峰,童光志,周艳君. 2021

[3]贵州省PRRSV分离株Nsp2基因的克隆及序列分析. 刘飞,王开功,周碧君,罗险峰,文明,安同庆,刘春国,程振涛,路宪礼,陈俊. 2010

[4]高致病性PRRS VORF3基因在昆虫细胞中的表达与免疫原性研究. 徐明明,蔡雪辉,刘永刚,王淑杰,王洪峰,石文达,李丽琴,荣福龙. 2010

[5]高致病性PRRSVORF3基因在昆虫细胞中的表达与免疫原性研究. 徐明明,蔡雪辉,刘永刚,王淑杰,王洪峰,石文达,李丽琴,荣福龙. 2010

[6]猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒Nsp2基因缺失株Jiangxi-3毒力的进一步研究. 张彩勤,赵炳武,宋长绪. 2010

[7]贵州省PRRSV分离株NSP2基因的克隆及序列分析. 刘飞,王开功,周碧君,罗险峰,文明,安同庆,路宪礼,陈俊,程振涛. 2010

[8]猪繁殖与呼吸综合征病毒非结构蛋白研究进展. 刘准,王凤雪,武华. 2010

[9]2013-2014年我国东北地区猪繁殖与呼吸综合征病毒GP5和NSP2基因遗传变异分析. 常晓博,叶超,赵款,姜成刚,王淑杰,蔡雪辉,张辉,安同庆. 2015

[10]2014-2017年山东省部分规模化猪场PRRSV ORF5基因的遗传演化分析. 曲向阳,孙英军,张洪亮,周磊,刘媛媛,任夫波,赖清华,夏天,周明明,杨汉春. 2018

[11]猪繁殖与呼吸综合征病毒CH-1R株致弱过程中ORF5基因遗传变异分析. 吴国军,蔡雪辉,刘永刚,王洪峰,王淑杰,石文达,马平,张琪,李成君. 2007

[12]PRRSV CH-1R株黏膜免疫效果的测定及其ORF5的遗传变异分析. 吴国军. 2007

[13]PRRSV新亚型毒株JL580的基因组变异特征研究. 常晓博,赵款,叶超,姜成刚,王淑杰. 2015

[14]2005年-2010年我国部分地区PRRSV流行毒株的遗传变异分析. 范培虎,危艳武,郭龙军,吴洪丽,黄立平,刘长明. 2011

[15]2005年~2010年猪繁殖与呼吸综合征病毒流行毒株的遗传变异分析. 范培虎,危艳武,郭龙军,黄立平,刘长明. 2010

[16]中国部分地区2005-2007年猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株ORF5基因和Nsp2基因遗传变异分析. 薛青红,张彦明,刘湘涛,郎洪武,邹敏,高金源,邓永. 2009

[17]2005~2010年猪繁殖与呼吸综合征病毒流行毒株的遗传变异分析. 范培虎,危艳武,郭龙军,黄立平,刘长明. 2010

[18]猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组遗传变异研究进展. 李真光,武华. 2009

[19]猪繁殖与呼吸综合征病毒诱导IL-10产生的分子基础研究. 夏天奇. 2015

[20]高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒致弱毒株NSP2复制非必需区的鉴定及其表达外源基因的研究. 徐彦召. 2012

作者其他论文 更多>>