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柑橘黄化花叶病毒的实时定量PCR检测及其在寄主植株中的时空分布规律

文献类型: 中文期刊

作者: 曹鹏 1 ; 许建建 1 ; 李楚欣 1 ; 王新亮 1 ; 王春庆 1 ; 宋晨虎 1 ; 宋震 1 ;

作者机构: 1.西南大学柑桔研究所

关键词: 柑橘黄化花叶病毒;实时荧光定量PCR;时空分布

期刊名称: 中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2023 年 018 期

页码: 3574-3584

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【背景】柑橘黄化花叶病毒(citrus yellow mosaic virus,CYMV)是首先发现于印度并对其柑橘产业造成严重危害的一种杆状DNA病毒。目前,CYMV已被美国、日本、新西兰、欧洲和地中海地区列入检疫性有害生物名单,具有传入我国的潜在风险。【目的】建立CYMV的实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,q PCR)检测体系;筛选CYMV敏感柑橘品种;明确CYMV在寄主植株中的时空分布规律,为该病毒的监控提供技术支持。【方法】根据NCBI中CYMV外壳蛋白(coat protein,CP)基因保守序列,利用软件Primer Premier 5设计q PCR检测引物8对,通过常规PCR筛选扩增效果好、特异性强的引物。通过对引物浓度、退火温度等反应条件优化,建立CYMV的q PCR检测体系,并进一步通过对不同柑橘病原的检测评价所建体系的特异性;以梯度稀释的1.98×10~9—1.98 copies/μL的质粒标准品平行进行常规PCR及q PCR检测,评价所建方法的灵敏度;随机采集田间柑橘样品,平行进行常规PCR及q PCR检测,评价所建方法的适用性。将CYMV接种到玉环柚(Citrus grandis)、强德勒柚(C.grandis)、22号枳(Poncirus trifoliata)等15个柑橘品种,进行症状观察和分子检测以筛选敏感指示植物。在接种后不同时间,分别自MV甜橙(C.sinensis)植株不同组织部位取样,以柑橘生长因子1α基因为内参基因,利用所建体系进行q PCR检测,从而明确CYMV在寄主植株中的时空分布规律。【结果】建立了CYMV的q PCR检测体系,其最佳引物为CYMV-q F7/R7,最佳引物浓度为200 nmol·L-1,最佳退火温度为63℃。该检测体系的特异性强,检测灵敏度是常规PCR的1 000倍。对来自不同地区的660个田间柑橘样品的检测结果表明,q PCR检测与常规PCR检测结果一致,除阳性对照外均未检测到CYMV阳性植株。不同柑橘品种接种试验结果表明,15个柑橘品种中,玉环柚和强德勒柚最早表现出强烈的黄化花叶典型侵染症状,可以作为敏感指示植物。q PCR检测结果表明,老叶中的CYMV滴度最高,老皮和根病毒滴度较高,嫩皮中的滴度较低。CYMV在植株中的相对含量,7—9月最高,此后逐月下降,并在次年1月达到最低值,从次年2月开始,CYMV的相对含量开始上升,与环境温度变化趋势一致。【结论】建立了特异性强、灵敏度高的CYMV实时荧光定量PCR检测方法,利用该方法明确了CYMV在寄主植株中的时空分布规律。此外,玉环柚和强德勒柚可作为CYMV敏感指示植物。

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