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P-PARV4全基因组克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈芯羽 1 ; 刘钟元 1 ; 孙文超 2 ; 赵翠青 1 ; 白杰英 3 ; 李昌 4 ; 刘立明 1 ;

作者机构: 1.吉林农业科技学院动物科技学院

2.温州大学病毒学研究所

3.吉林省金泰美迪生物技术有限公司

4.中国农业科学院长春兽医研究所中国医学科学院人兽共患病毒病防控关键技术研究创新单元

关键词: 猪hokovirus;猪细小病毒4型;系统发育演化

期刊名称: 中国兽医学报

ISSN:

年卷期: 2023 年 006 期

页码: 1139-1144

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究广西地区猪hokovirus(PHoV)又称猪PARV4 (P-PARV4)毒株流行情况和遗传进化特征,对采自广西地区猪组织样品进行检测,扩增出其中1株全基因序列,命名为YL172(GenBank登录号:KX827773)。感染率调查结果显示,广西地区成年猪P-PARV4感染率为95.0%。同源性分析结果显示,P-PARV4 YL172株全基因组与喀麦隆、欧洲、美国和中国参考株同源性为96.1%~99.3%;YL172株NS1基因与参考株同源性为97.0%~99.5%;YL172株VP2基因与参考株同源性为93.4%~99.1%。VP2遗传进化分析结果显示,P-PARV4分离株存在2个亚群,YL172株与中国参考株GX1、SH1、JSNJ处在同一进化分支,而美国参考株US-HK133与HK1则处在另一进化分支。

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