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野鸟源H9N2亚型流感病毒感染小鼠的ceRNA调控机制研究

文献类型： 中文期刊

作者： 刘慧珍 1 ; 姚秋成 1 ; 高玉伟 2 ; 葛叶 1 ;

作者机构： 1.广东海洋大学滨海农业学院

2.中国农业科学院长春兽医研究所

关键词： H9N2亚型禽流感病毒;circRNA;miRNA;mRNA;ceRNA调控网络

期刊名称： 中国病原生物学杂志

ISSN： 1673-5234

年卷期： 2023 年 006 期

页码： 630-636

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的 禽流感是由禽流感病毒（AIV）引起的一种从轻微呼吸道症状到急性、败血性传染病综合征。非编码RNA在禽流感病毒复制中的联合作用尚不清楚，尤其是circRNA表达谱及其对AIV感染发病机理的影响尚有很多空白。本研究旨在明确野鸟源H9N2亚型流感病毒感染小鼠的ceRNA调控机制。方法 利用RNA高通量测序和生物信息学方法分析野鸟源H9N2亚型AIV感染小鼠后其肺脏组织circRNAs水平的变化，并以circRNA为ceRNA调节靶标构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果 通过系统分析AIV感染小鼠肺脏中的circRNA及miRNA和mRNA表达谱，共鉴定到5 335个不同的circRNAs,并分别筛选到654、85和1 387个差异表达的circRNA、 miRNAs和mRNAs。基于基因本体（GO）及京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析表明，差异表达circRNAs的宿主基因主要参与先天免疫反应，细胞生长和死亡、信号转导、免疫系统、免疫疾病。此外，对circRNA-miRNA-mRNA调控网络的整体分析显示，在H9N2亚型AIV感染中存在许多circRNA-miRNA-mRNA相互作用，其中筛选出的144个过表达circRNA可能存在通过吸附miR-185-5p和miR-34c-5p使其表达下调，从而使下游的功能基因表达上调，诱导宿主细胞钙离子信号通路，进而促进H9N2病毒感染的潜在发病机制。结论 通过鉴定circRNA的表达谱和构建circRNA相关的调控网络，揭示了一个丰富的circRNAs和ceRNA网络参与H9N2病毒感染的调控，为H9N2病毒与宿主的相互作用及发病机制提供了新的见解。

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