大蒜病毒多重RT-PCR检测体系的建立与应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵永强

作者： 赵永强;樊继德;陆信娟;刘灿玉;张碧薇;杨青青;葛洁;史新敏;杨峰

作者机构：

关键词： 大蒜;病毒;多重RT-PCR;检测体系

期刊名称： 北方农业学报

ISSN： 2096-1197

年卷期： 2023 年 001 期

页码： 22-30

摘要： 【目的】建立一套多重RT-PCR方法，用于同时检测和鉴别大蒜大田植株和组培苗5种病毒/病毒组。【方法】根据相关文献和GenBank公布的参考病毒株序列，设计了5对分别针对青葱潜隐病毒（Shallot latent virus,ShLV）、大蒜普通潜隐病毒（Garlic common latent virus,GarCLV）、韭葱黄条病毒（Leek yellow stripe virus,LYSV）、洋葱黄矮病毒（Onion yellow dwarf virus,OYDV）和青葱X病毒属病毒（allexiviruses）的特异性引物，扩增产物大小分别为592、431、338、265、190 bp。利用建立的多重RT-PCR方法，分别对24份大蒜组培苗和48份大田样本进行病毒检测分析。【结果】通过单重/多重PCR及序列比对验证了检测系统的特异性。通过退火温度和引物比例优化，确定退火温度为56.6℃且ShLV、GarCLV、LYSV、OYDV、allexiviruses引物体积比为10∶8∶3∶3∶16时，扩增效果最好。5种病毒/病毒组的最低检测浓度均为1.0×102copies/μL。大蒜组培苗病毒检测结果具有丰富的多样性，大田样品被至少2种病毒/病毒组感染，病毒/病毒组之间可以清晰区分。【结论】开发的多重RT-PCR方法可以快速、有效地检测和鉴别大蒜ShLV、GarCLV、LYSV、OYDV和allexiviruses这5种病毒/病毒组的感染情况。

分类号： S436.33

  • 相关文献

[1]江苏省葫芦科作物6种病毒的多重RT-PCR方法及应用. 任春梅,程兆榜,杨柳,缪倩,周益军. 2015

[2]马铃薯5种病毒多重PCR检测技术的建立及应用. 罗文彬,李华伟,汤浩,邱思鑫,纪荣昌,许泳清,刘中华,邱永祥. 2015

[3]文心兰3种主要病毒多重RT-PCR检测体系的建立. 樊荣辉,黄敏玲,钟淮钦,吴建设,罗远华. 2015

[4]猪流感病毒H1N1、H1N2和H3N2亚型多重RT-PCR诊断方法的建立. 杨焕良,乔传玲,陈艳,辛晓光,李一经,陈化兰. 2007

[5]甜樱桃病毒病分子检测技术的研究. 宗晓娟,王文文,王甲威,魏海蓉,朱东姿,谭钺,刘庆忠. 2014

[6]三种无花果病毒的多重RT-PCR检测. 吐逊艾力·艾孜提力,侯婉莹,郭庆元,古丽尼沙·卡斯木,代毅,李世访,麦合木提江·米吉提. 2021

[7]菊花5种病毒及类病毒多重RT-PCR检测方法的建立. 张利英,王森,陈东亮,喻锌,姜宝龙,程钰涵,李彦慧,黄丛林. 2023

[8]黑龙江省大蒜病毒病原鉴定及病毒病发生情况调查. 张威,白艳菊,申宇,高艳玲,范国权,耿宏伟,孟宪欣. 2010

[9]加快建立农业生产标准与检测体系. 田世龙,车宗贤,朱友春. 2003

[10]热带农作物种子(苗)质量检验检测体系的现状与思考. 申志斌. 2002

[11]反相高效液相色谱法测定甘蓝叶球中的抗癌活性成分吲哚-3-甲醇. 李占省,刘玉梅,方智远,杨丽梅,庄木,张扬勇,赵文,孙培田. 2011

[12]宁夏葡萄产业发展中病毒病检测体系建立的重要性. 王国珍. 2003

[13]美国农业部质检系统及对我国的借鉴. 杨桂玲,张志恒,袁玉伟,孙彩霞,郑蔚然. 2011

[14]甘蓝型油菜SSR检测体系的优化. 张洁夫,戚存扣,浦惠明,陈锋,顾慧,陈新军,高建芹,傅寿仲. 2004

[15]湖北省县级农产品质检体系建设现状及对策建议. 邢美华,龚艳,王永德,胡定金. 2013

[16]广西农产品质量安全检测体系建设现状调查. 陈自力,邱映含,莫嘉凌,刘东. 2012

[17]浅议尽快建设我国生鲜乳质量检测体系的必要性. 王建平,王加启,周振锋,孙鹏,张海涛,卜登攀,霍小凯,郭同军. 2009

[18]柑桔黑斑病菌的快速识别鉴定. 王娟,徐丽兰,胡军华,姚廷山,周娜,王雪莲,李鸿筠. 2015

[19]完善我国水产品质量安全检验检测体系建设的研究与思考. 刘欢,马兵,宋怿,穆迎春,时文博. 2010

[20]宁夏农产品安全检测体系的科学构建. 苟春林. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序