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应用双分子荧光互补技术研究靶标肽与互补肽之间的互作关系

西南农业学报 2023 北大核心 CSCD

摘要:【目的】基于双分子荧光互补(Bimolecular fluorescence complementation, BiFC)技术研究依据猪流行性腹泻病毒(PEDV)S蛋白受体结合位点肽段的靶标肽与互补肽在活细胞内的相互作用关系以及定位情况,为进一步利用该多肽进行猪流行性腹泻病毒的检测积累前期基础和提供理论支撑。【方法】依据靶标蛋白的氨基酸组成、所带电荷种类、形成分子间氢键的能力、极性的强弱、疏水性能等理化特性设计出靶标肽;根据靶标蛋白的氨基酸组成,设计出在理论上与其相互作用的互补肽,并利用生物信息学工具对靶标肽与互补肽进行预测分析;将靶标肽与互补肽的核苷酸序列分别插入EcoRΙ/XhoΙ双酶切后的pBiFC-VC155与NotΙ/SalΙ双酶切后的pBiFC-VN173载体中,构建出BiFC真核表达载体,经酶切及测序验证正确后转染Vero细胞来研究靶标肽与互补肽的互作关系以及形成的BiFC复合物在细胞内的精确定位。【结果】生物信息学分析表明靶标肽和互补肽分别带有亲水性和疏水性结构域,亲水性结构域都带有正负电荷,能够产生静电引力;酶切鉴定和测序结果表明成功构建了pBiFC-VC155-靶标肽和pBiFC-VN173-互补肽真核表达质粒;细胞转染试验表明重组质粒共同转染后靶标肽和互补肽能够在Vero细胞内形成BiFC复合物,表明两者发生了相互作用;间接免疫荧光试验证实该BiFC复合物主要分布于细胞核中。【结论】研究证实了基于猪流行性腹泻病毒S蛋白受体结合位点肽段设计的多肽能够在活细胞内发生相互作用,表明该肽段用于检测的可行性。

关键词: 猪流行性腹泻病毒 靶标肽 互补肽 蛋白互作 双分子荧光互补 病原诊断

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基于SSA-LSTM模型的黄鳝池溶氧预测研究

渔业现代化 2023 北大核心 CSCD

摘要:溶氧含量是影响黄鳝养殖的重要因素,为提高黄鳝池溶氧浓度的预测精度,提出一种基于麻雀搜索算法(SSA)和长短期记忆神经网络(LSTM)的黄鳝池溶氧浓度预测模型,即利用SSA算法优化LSTM模型的超参数后,对循环水黄鳝养殖池的溶氧浓度进行预测.结果显示:基于SSA-LSTM模型的预测准确率为96.77%,相较于对照模型LSTM、门控循环单元(GRU)、粒子群算法-长短期记忆神经网络(PSO-LSTM)分别提升了2.09%、3.34%、0.55%.该模型其他指标均方误差(EMSE)、平均绝对误差(EMAE)、均方根误差(ERMSE)分别为0.67、0.53、0.81,相较于对照模型也有明显下降.研究表明,利用SSA-LSTM模型预测黄鳝池溶氧浓度具有良好的准确性和鲁棒性,可以为黄鳝养殖中水质参数精准调控提供依据.

关键词: 溶氧预测 LSTM 麻雀搜索算法 黄鳝养殖

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冬季不同脱温时间对鹅生长性能、免疫指标和肠道形态的影响

中国畜牧杂志 2023 北大核心 CSCD

摘要:为探讨地面育雏形式下冬季不同脱温时间对肉鹅的生长影响,以获得合适的冬季育雏时间,优化饲养管理,本试验选取800只0日龄健康霍尔多巴吉雏鹅,按体重随机分为2个处理组,每个处理8个重复,每个重复50只鹅。2个处理组分别在育雏3周和4周脱温,后饲养至10周屠宰取样,测定生长性能、血清生化、血清细胞因子和肠道形态等指标。结果显示:(1) 4周脱温处理较3周脱温处理能显著提高霍尔多巴吉鹅4周的体重和平均日增重,对4~10周鹅的生长性能、死淘率和器官指数无显著影响;(2) 2个处理组鹅的血清生化各指标无显著差异,3周脱温处理较4周脱温处理能显著提高霍尔多巴吉鹅血清白介素-10(IL-10)水平;(3) 4周脱温处理较3周脱温处理显提高了鹅血清D乳酸(D-LA)水平,极显著降低了十二指肠和回肠的绒毛高度与绒隐比、十二指肠和回肠的黏膜厚度、十二指肠和空肠的肠壁厚度、空肠绒毛宽度、空肠与回肠的绒毛面积。综上,4周育雏后脱温较3周育雏后脱温能显著增加霍尔多巴吉鹅的育雏结束体重,但对4~10周鹅的生长性能无显著影响,4周育雏后脱温较3周育雏后脱温会降低霍尔多巴吉鹅的肠道完整性和免疫能力。综合饲养、劳动力和饲料成本,冬季育雏时间建议在3周左右。

关键词: 鹅育雏 饲养管理 生长性能 肠道形态 饲养成本

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我国稻米食味品质的研究进展及其影响因素

上海农业学报 2023 北大核心 CSCD

摘要:随着水稻产业体系的飞速发展,稻米的食味品质引起广泛关注.研究对比了国内外稻米食味品质的研究现状,简述了我国近年来稻米食味品质的研究历程,细化和列举了影响稻米食味品质的主要指标:蛋白质含量、淀粉含量、淀粉的糊化特性和胶稠度,并分别阐述了这四个指标的检测方法和检测标准.同时,分析了现有的稻米食味品质的综合检测方法,如感官评价法、理化指标检测评价法和无损检测评价法及其对应的评价标准.最后,对今后的发展方向进行了展望,认为应通过精准评价构建科学规范、本国化的稻米食味品质评价标准/系统,实现食味型水稻真正的本地化和产业化.

关键词: 稻米 食味 检测方法 检测指标 农事管理

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草菇smHsp基因生信分析及热激对其在低温下表达的诱导

分子植物育种 2023 北大核心 CSCD

摘要:热激蛋白是生物体抵御逆境的重要蛋白之一,高温胁迫是诱导热激蛋白产生的主要因素,其中smHsp基因可以在高温诱导时大量产生。本研究对草菇smHsp基因进行了生物信息学分析,以草菇低温敏感型菌株V23和耐低温型菌株VH3为试验材料,研究了经过热激处理再进行低温胁迫后草菇smHsp基因的相对表达量变化。结果表明,草菇smHsp基因定位于细胞质内,该蛋白不存在信号肽及跨膜结构,属于Hsp20家族,与滑子菇(Pholiota nameko)亲缘关系较近。热激处理显著提高了草菇菌株V23和VH3在低温胁迫下菌丝体中smHsp基因的相对表达量,可能有助于增强草菇的耐低温胁迫能力。

关键词: 热激 低温 smHsp 生物信息学 诱导表达

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不同光质处理对芹菜幼苗生长及叶片荧光诱导动力学的影响

北方园艺 2023 北大核心

摘要:以黄心芹为试材,采用人工补光的方法,设置光质分别为纯红光(R)、红光∶蓝光=3∶1(3R1B)、红光∶蓝光=1∶3(1R3B)、纯蓝光(B)以及对照组白光(W),探究了不同的红蓝光比例对芹菜幼苗的生长和光合系统电子传递的影响,以期筛选出适宜的壮苗处理并了解红蓝光对芹菜幼苗光系统的调控机制。结果表明:与对照相比,R处理显著促进芹菜幼苗株高、叶面积的增加但显著减小了茎粗和根长,B处理则相反,幼苗株高和叶面积最小,但根长和茎粗最大;B的壮苗指数最高,并且总鲜质量和总干质量的积累仅次于R处理;1R3B和3R1B的表型差异和生物量的差异并不明显。相比于R和3R1B,W、B、1R3B更有利于光合色素的积累。通过OJIP曲线及JIP-test分析发现,R处理的J点相对荧光强度显著大于其它处理并且I点同样为最大,这说明红光抑制了PSⅡ受体侧QA、QB和PQ库的还原,抑制了电子传递及PSⅡ活性。该研究中,单色蓝光处理的壮苗指数最高,并且拥有较高的生物量和光合色素积累,PSⅡ的电子传递系统未发现被抑制,是比较理想的育苗光质。

关键词: 芹菜幼苗 红蓝光 幼苗生长 OJIP曲线 光合电子传递

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不同基质及播种密度对移动式NFT活体盆栽香葱生长的影响

上海农业学报 2023 北大核心 CSCD

摘要:以3 个香葱品种为试材,研究不同栽培基质和播种密度对移动式NFT活体盆栽香葱生长的影响.结果表明:香葱的成苗率主要由品种特性决定,'荣宝603'和'荣剑'均有较高的成苗率;单盆鲜重同时受品种、播种数量和栽培基质的影响,在细沙栽培条件下'荣剑'品种播种密度为 10 粒/盆时表现最优;香葱总成本的差异主要由栽培基质决定,使用细沙作为栽培基质成本最低,其中'荣剑+播种 10 粒/盆+细沙基质'组合的单位成本最低,为3.88 元(人民币,下同)/kg.综上,'荣剑+播种10 粒/盆+细沙基质'组合的生产方式具有成苗率高、产量高和生产成本低的特性,是移动式NFT活体盆栽香葱的适宜生产方式.

关键词: 香葱 栽培基质 播种密度 成苗率 产量

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上海优质食味粳稻产业发展现状与展望

中国稻米 2023 北大核心

摘要:从2013—2022年上海水稻品种选育、推广情况,并结合上海优质食味粳稻品牌建设、营销模式情况,全面介绍了上海近年优质食味粳稻产业发展的现状,剖析了目前上海优质食味粳稻产业存在的问题,并对未来发展提供了建议。

关键词: 优质食味粳稻 发展现状 产业问题 对策建议 上海

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纤维源组成对浙东白鹅生长性能和消化功能的影响

上海农业学报 2023 北大核心 CSCD

摘要:为探讨稻壳和麦麸作为饲粮纤维源养殖浙东白鹅的效果及适当比例,将180 只28 日龄浙东白鹅随机分为3 组,分别饲喂稻壳与麦麸添加比例为(5∶9)、(5∶1)和 100%稻壳的饲粮,并测定各组生长性能、消化器官质量与消化酶活性、食糜pH以及饲粮营养成分的表观消化率.结果显示:当饲粮中稻壳与麦麸添加比例由(5∶9)增加至 100%稻壳时,浙东白鹅的体质量与料重比均显著增加;肌胃和胰腺的质量有增加趋势,肌胃食糜pH有降低趋势,但处理间差异均不显著;胰腺中碱性磷酸酶活性显著降低,胆碱酯酶活性显著升高.当稻壳与麦麸添加比例增加至(5∶1)时,浙东白鹅苏氨酸、赖氨酸和组氨酸等必需氨基酸以及总磷的表观利用率显著降低.综上,4-8 周龄浙东白鹅饲粮中稻壳与麦麸的添加比例为(5∶1)—100%稻壳时,其生产性能与经济效益综合效果最佳.

关键词: 稻壳 麦麸 浙东白鹅 生长性能 消化酶活性 表观利用率

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花豹1号节瓜的品种特性及轻简化高产栽培技术

上海蔬菜 2023

摘要:近年来,节瓜以外观小巧、肉色翠绿、肉质脆嫩、口感清甜受到上海市民的欢迎。2021年上海星辉蔬菜有限公司科技人员从上海市农业科学院设施园艺研究所引进花豹1号节瓜开展了种植试验。在连续2年的种植试验中,花豹1号节瓜田间表现较好,每667 m~2产量9 000 kg,每667 m~2种植效益达13 500元,且管理简便,省工省力。该文介绍了花豹1号节瓜的品种特性,并从育苗、整地定植、田间管理、病虫害防治、采收等方面介绍了其轻简化高产栽培技术。

关键词: 花豹1号节瓜 品种特性 栽培技术 轻简化 上海地区

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