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桑桑牦牛MYL7基因克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 马荣 1 ; 洛桑顿珠 2 ; 平措占堆 2 ; 卓玛次仁 2 ; 尼玛加措 2 ; 成述儒 2 ; 梁春年 2 ;

作者机构： 1.中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所

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关键词： 桑桑牦牛;MYL7基因;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 中国草食动物科学

ISSN：

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 15-21

摘要： 克隆西藏桑桑牦牛肌球蛋白轻链7(Myosin light chain 7,MYL7)基因CDS区,进行生物信息学分析并检测该基因在各组织中的表达差异,为探究该基因功能提供一定的理论依据.以桑桑牦牛肌肉组织cDNA为模板,利用PCR技术克隆其CDS区序列,并利用多种在线生物软件及工具进行生物信息学分析.结果表明,桑桑牦牛MYL7基因CDS区长447 bp,共编码148个氨基酸,该基因编码的蛋白分子式为C743H1155N187O237S7,原子数为2329个,理论等电点为4.37,不稳定系数和总平均亲水性分别为36.02和-0.364,属于稳定的亲水性蛋白;具有特异性的磷酸化位点11个,其中5个丝氨酸、5个苏氨酸和1个酪氨酸.MYL7蛋白无信号肽和跨膜螺旋结构,属于非分泌性蛋白.通过亚细胞定位发现,桑桑牦牛MYL7基因在线粒体、细胞核、细胞质、细胞膜中均有所分布.蛋白高级结构主要是α-螺旋和无规则卷曲.通过构建系统进化树发现,桑桑牦牛与野牦牛亲缘关系最近,符合实际情况,说明MYL7基因在进化过程中具有一定的保守性.

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