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新型鸭细小病毒NS1基因的原核表达及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张经伟 1 ; 李琦 1 ; 陈宗艳 1 ; 宫晓华 1 ; 李国新 1 ; 温建新 2 ; 朱杰 1 ; 李传峰 1 ; 刘光清 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院上海兽医研究所

2.青岛农业大学动物科技学院

关键词: 新型鸭细小病毒;克隆;原核表达;生物信息学

期刊名称: 中国动物传染病学报

ISSN: 1674-6422

年卷期: 2017 年 25 卷 02 期

页码: 49-55

收录情况: 北大核心

摘要: 为研究新型鸭细小病毒(Novel duck parvovirus,NDPV)NS1蛋白的生物学功能,根据NDPV DS15株NS1基因(Gen Bank登录号:KU947420)设计1对特异性引物,对NS1全基因进行PCR扩增,将PCR扩增产物克隆入pGEX-4T-1载体,构建重组质粒pGEX-4T-NS1,并进行测序鉴定。经鉴定正确后重组质粒转化到BL21感受态细胞,SDS-PAGE和Western blot进行表达鉴定。将测序获得NS1基因编码蛋白进行生物信息学分析。结果显示,本研究构建的重组质粒可在原核细胞中成功表达97kDa的NS1融合蛋白。进一步生物信息学分析结果显示,NS1蛋白为酸性、可溶性蛋白,由627个氨基酸组成,分子质量约为72kDa。该蛋白主要位于胞浆,不含信号肽序列,无跨膜区,含有丝/苏氨酸激酶底物模序和1个潜在磷酸化位点(s546),抗原表位主要集中在多肽的C端。NS1基因的同源性及系统发生树分析表明,NDPV与鹅细小病毒(Goose parvovirus,GPV)处于同一进化分支,遗传进化关系最近。本研究结果为揭示NDPV NS1在病毒的复制、增殖以及致病机制中的作用奠定了基础。

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