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冷胁迫下王百合GPAT基因保守区克隆及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈丽静 1 ; 孙春玉 1 ; 钟鸣 1 ; 阮燕晔 1 ; 明军 2 ; 雷家军 1 ;

作者机构: 1.沈阳农业大学辽宁省生物技术重点实验室

2.中国农业科学院蔬菜花卉研究所

关键词: 王百合;冷诱导;甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT);简并引物;保守区;同源性

期刊名称: 西北植物学报

ISSN: 1000-4025

年卷期: 2011 年 31 卷 09 期

页码: 1726-1731

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以王百合为试验材料,通过同源克隆和巢式PCR方法从4℃低温诱导的王百合试管苗中分离得到了王百合GPAT基因的保守区序列,采用DNAman软件和BLASTN对该序列进行分析并分别从蛋白和基因角度分析了GPAT基因在4℃冷诱导情况下的表达情况.结果显示:(1)该保守区长744 bp,推测其编码247个氨基酸,氨基酸序列存在1个高度保守的区域(WIAPSGGRDRP),经过Blast比对分析发现,该保守区序列为LPLAT基因超级家族酶类的催化活性区,此家族多为催化酰基辅酶A(acylCoAs)或者酰基载体蛋白(acylACPs)中的酰基与受体蛋白结合的酰基转移酶类.(2)冷诱导促进GPAT基因的表达,随冷诱导时间延长,基因表达量不断增大,诱导4 h有大量表达,16 h表达量达到最高,16 h之后表达量随着冷诱导时间的延长逐渐下降,72 h时的表达量与0 h处理时基本一致.研究表明,GPAT在百合抵抗冷胁迫的过程中具有重要的作用.

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