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水稻全基因组选择信号检测方法比较及选择策略

文献类型: 中文期刊

作者: 王君瑞 1 ; 郑晓明 2 ; 崔永霞 3 ; 李嘉琦 4 ; 李飞 2 ; 宋珗 2 ; 格金月 2 ; 乔卫华 2 ; 程云连 2 ; 张丽芳 2 ; 姜明国 1 ; 杨庆文 2 ;

作者机构: 1.广西民族大学海洋与生物技术学院广西多糖材料与改性重点实验室

2.中国农业科学院作物科学研究所

3.西南医科大学附属医院肿瘤科

4.辽宁省果树科学研究所

关键词: 水稻;基因组;选择信号;检测方法比较

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2025 年 23 卷 017 期

页码: 5644-5658

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 作物经历驯化而来,驯化过程中会在基因组上留下特定的选择信号,对这些选择信号进行研究是挖掘重要功能基因的重要手段之一。当前已经涌现出了大量的统计方法用来检测基因组上的选择信号。因此,为了给研究者提供清晰的选择依据,本研究利用水稻基因组数据,根据选择信号的种类和检测方法,选取8种常用检测选择信号的统计方法对水稻全基因组的选择信号进行检测并进行比较分析,通过水稻主要驯化性状分析和比较不同统计方法的原理和生物学意义,为生物进化研究选择合理的统计分析方法和软件提供一定参考。

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