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固氮施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501同化硝酸盐代谢基因簇分布及调控研究

文献类型: 中文期刊

作者: 黄丽玲 1 ; 李耘 1 ; 王珊珊 1 ; 陆超 1 ; 杨智敏 1 ; 林敏 1 ; 燕永亮 1 ; 陈明 1 ; 张维 1 ; 王劲 1 ; 周正富 1 ; 柯秀彬 1 ; 战嵛华 1 ; 陆伟 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院生物技术研究所

关键词: 施氏假单胞菌A1501;硝酸盐同化;基因簇;途径特异性控制

期刊名称: 中国农业科技导报

ISSN:

年卷期: 2021 年 007 期

页码: 72-81

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 固氮施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501在有氧条件下能够利用硝酸盐/亚硝酸盐为唯一氮源生长,表明该菌除了具有固氮和反硝化等氮循环系统外还有同化硝酸盐/亚硝酸盐系统。为进一步阐明该菌同化硝酸盐的代谢机制,利用生物信息学手段分析了硝酸盐同化相关基因的组成及分布情况,并初步研究了同化硝酸盐途径特异性调控关系。结果表明,P.stutzeri A1501中存在两个硝酸盐同化基因簇nasST-nasA-nirBDnasBcobA和nasR-nasFED,分布于基因组不同部位。第一个基因簇中nasS-nasT编码二元抗转录终止因子,nasA编码NarK/NasA家族硝酸盐转运蛋白,nirBD编码亚硝酸盐还原酶,nasB编码同化硝酸盐还原酶,cobA编码参与西罗血红素合成的尿卟啉-ⅢC-甲基转移酶;第二个基因簇中nasR编码单一组分抗转录终止因子,nasFED编码ABC型(ATP依赖)硝酸盐/亚硝酸盐转运蛋白。NasS-NasT双组分蛋白调控硝酸盐/亚硝酸盐还原酶基因的转录,NasR调控硝酸盐/亚硝酸盐转运蛋白基因的转录。

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