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传染性支气管炎CK/CH/HD/190716株的分离鉴定与全基因组分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨彬 1 ; 徐智凯 1 ; 李梦娇 2 ; 袁艳梅 2 ; 宫晓倩 2 ; 刘炜玮 2 ; 孙英杰 2 ; 宋翠萍 2 ; 谭磊 2 ; 仇旭升 2 ; 廖瑛 2 ; 丁铲 2 ; 王金泉 1 ; 孟春春 2 ;

作者机构: 1.新疆农业大学动物医学学院

2.中国农业科学院上海兽医研究所

关键词: 传染性支气管炎病毒;分离与鉴定;遗传进化;重组分析

期刊名称: 中国兽医杂志

ISSN: 0529-6005

年卷期: 2020 年 006 期

页码: 5-9,14,141

收录情况: 北大核心

摘要: 对河北某免疫鸡场采集疑似感染传染性支气管炎病毒(IBV)鸡的肺脏进行病毒分离,并通过鸡胚接种和全基因序列测定分析,对分离病毒进行鉴定和遗传变异分析.分离到1株IBV,命名为CK/CH/HD/190716,该病毒接种鸡胚后可产生IBV特征性的侏儒胚.该病毒基因组总长为27 680 bp,其中Ploy A尾含有16个A.将分离株基因序列与不同基因型的IBV毒株进行同源比对,构建遗传进化树进行基因分型,证实该毒株属于QX型.选取我国分离的14株QX型IBV与之比较同源性,发现该型病毒全基因组的同源性在93%~97%,但是5a基因的同源性最低,只有80%,表明IBV各基因之间的进化具有显著差异.随后通过多个重组软件分析证实,该毒株的1a基因部分区域由QX型野毒KX425847和KU317090重组产生.本试验揭示了我国流行的QX型IBV存在基因多样性,需要对该型病毒的遗传演化进行密切监测.

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