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用于水稻品种真实性验证的SNP位点评价

文献类型: 中文期刊

作者: 徐群 1 ; 王珊 1 ; 袁筱萍 1 ; 金石桥 2 ; 晋芳 2 ; 郝万军 3 ; 吴小碧 3 ; 冯跃 1 ; 余汉勇 1 ; 孙燕飞 1 ; 杨窑龙 1 ; 魏兴华 1 ;

作者机构: 1.中国水稻研究所水稻生物育种全国重点实验室

2.全国农业技术推广服务中心

3.浙江省种子管理总站

关键词: 水稻品种;真实性鉴定;RGIsnp96;单核苷酸多态性;品种鉴定

期刊名称: 中国水稻科学

ISSN: 1001-7216

年卷期: 2025 年 39 卷 005 期

页码: 635-642

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】高鉴别力的SNP位点组合对建立高效、精准、低成本的水稻品种验证技术至关重要,可广泛应用于种子监管和品种创新等领域。【方法】利用农业行业标准推荐的96个SNP标记(RGIsnp96),构建1383个常规种和2702个杂交种水稻品种的SNP指纹图谱。【结果】发现在常规种中,杂合基因型比率、平均多态性信息成分(PIC)、平均次要等位基因频率(MAF)分别为0.03、0.30和0.27;在杂交种中,相关指标分别为0.39、0.30和0.29。RGIsnp96对常规稻、杂交稻的品种识别率分别为99.94%、99.99%。基于品种间异同基因型位点的比例,对RGIsnp96与农业行业标准推荐的48个SSR标记(RGIssr48)的鉴定结果进行比较,结果显示,不论是对于常规种、还是杂交种,这两套标记均具有良好的等效性。同时,还发现对部分常规品种的鉴别,组合不同类型的标记,比单一类型的标记能取得更好的效果,并推荐了相应的策略。【结论】RGIsnp96展现出卓越的水稻品种鉴别能力,为提升水稻种子质量、规范种子市场秩序以及保障农民权益提供了坚实的技术支持。

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