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浙江省水稻种质资源的遗传相似度分析

文献类型: 中文期刊

作者: 严志琴 1 ; 章孟臣 1 ; 陈小央 2 ; 李燕 2 ; 徐群 1 ; 王珊 1 ; 冯跃 1 ; 魏兴华 1 ; 杨窑龙 1 ;

作者机构: 1.中国水稻研究所/水稻生物育种全国重点实验室

2.浙江省种子管理总站

关键词: 稻种资源;核心SNP标记;遗传相似度;表型变异

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2025 年 26 卷 009 期

页码: 1734-1743

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 浙江省水稻栽培历史悠久,拥有丰富的稻种资源。目前保存在国家水稻种质资源中期库(杭州)的浙江省稻种资源共有2000余份,但并没有进行系统的筛选鉴定,导致一些稻种资源重复保存。以1970份浙江省原产稻种资源为研究材料,利用第二代重测序技术构建了浙江省稻种资源的基因组变异图谱,通过测序深度、连锁不平衡、缺失率等条件对SNP进行过滤,筛选10532个核心SNP标记用于遗传相似度计算。对13组主要的同名品种进行分析,同名品种之间的遗传相似度均未超过0.95,且相互之间存在较大的表型变异,因此同名材料间实际为不同的水稻品种。同时利用1970份材料的核心SNP标记,通过计算两两遗传相似度,筛选出11个高遗传相似度的材料组合。比较表型鉴定结果、植株形态特征发现,高遗传相似度的材料具有高度相似的表型与田间表现,在一定程度上证实了遗传相似度在水稻品种鉴定中的有效性。本研究基本摸清了浙江省水稻种质资源保存现状,揭示了同名品种不一定为重复品种,而异名品种也可能属于同一品种,为浙江省水稻种质资源的保护和利用提供了重要的科学依据。

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