文献类型： 中文期刊

作者： 李慧颖 ¹ ; 刘庆 ² ; 郭旻 ¹ ; 王克剑 ² ; 严长杰 ¹ ; 王春 ² ;

作者机构： 1.扬州大学农学院江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室江苏省作物基因组学与分子育种实验室

2.中国农业科学院中国水稻研究所水稻生物学重点实验室

关键词： 5-甲基胞嘧啶;甲基化特异位点检测;高通量测序平台;Hi-Meth

期刊名称： 生物工程学报

ISSN： 1000-3061

年卷期： 2022 年 38 卷 008 期

页码： 3049-3061

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 胞嘧啶甲基化是DNA表观遗传修饰的主要类型之一,在维持正常细胞功能和调控基因表达中具有重要作用.重亚硫酸盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)是特异性位点DNA甲基化检测的通用方法,能明确目的片段中每一个CpG位点的甲基化状态,但此方法需要大量的单克隆测序,操作过程较繁琐、成本昂贵.因此,开发准确、高效、便捷的DNA甲基化检测技术对提升表观遗传研究效率具有重要意义.基于本课题组开发的高通量突变类型检测平台Hi-TOM(high-throughput tracking of mutations),我们进一步建立了特定位点DNA甲基化高通量检测平台Hi-Meth(high-throughput detection of DNA methylation).DNA 样品通过重亚硫酸盐处理之后,仅需一轮PCR扩增即可通过Hi-Meth平台获得特定位点DNA甲基化分析结果.利用Hi-Meth平台,对水稻不同基因启动子区域进行了 DNA甲基化检测分析,并与基于BSP方法获得的结果进行了比较.结果 表明,Hi-Meth策略与BSP策略检测结果基本一致.而且通过Hi-Meth平台可以更准确、便捷地获得特异性位点DNA甲基化分析结果.综上所述,Hi-Meth为特定DNA区域提供了重要的甲基化检测平台,对表观遗传研究具有重要意义.