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地熊蜂内参基因的筛选和稳定性研究

文献类型: 中文期刊

作者: 夏中炎 1 ; 刘福罡 1 ; 杨帆 1 ; 张志浩 1 ; 杨俊豪 1 ; 杨慧鹏 1 ; 李继莲 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院蜜蜂研究所

关键词: 地熊蜂;内参基因;基因筛选;实时荧光定量PCR;稳定性分析

期刊名称: 应用昆虫学报

ISSN: 2095-1353

年卷期: 2024 年 61 卷 005 期

页码: 959-969

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】内参基因的选择在昆虫基因表达研究中尤为重要。本研究利用实时荧光定量PCR技术对5个候选内参基因在地熊蜂Bombus terrestris三型蜂的4种组织中的表达进行稳定性评价,筛选出地熊蜂相关基因表达定量研究的最佳内参基因。【方法】本研究针对GenBank数据库中地熊蜂Actin5C、PLA2(磷脂酶A2)、S18、S28、EF-1α(延伸因子)共5个候选内参基因的核酸序列设计并筛选出特异性引物;标记刚羽化出房的熊蜂工蜂、蜂王和雄蜂,放回原蜂群饲养,分别取1、3、5、7和10日龄蜂的头、卵巢、腹神经索和储精囊4个组织,提取总RNA;反转录PCR克隆候选内参基因片段;以TA克隆将候选内参基因片段克隆进T载体;含有内参基因片段的T载体经测序验证后,作为模板,通过实时荧光定量PCR,优化候选内参基因的扩增条件并绘制候选内参基因荧光定量扩增的标准曲线,在此基础上测定候选内参基因在地熊蜂三型蜂4个组织中的表达量,并以NormFinder、BestKeeper、GeNorm、ΔCT以及RefFinder 5种软件评价候选内参基因在三型蜂4种组织中的稳定性。【结果】不同软件对候选内参基因的稳定性排序具有一定差异,以RefFinder综合分析结果显示,蜂王和雄蜂头部、工蜂和雄蜂腹神经索、工蜂卵巢中最稳定的内参基因为PLA2,蜂王卵巢和工蜂头部最稳定的内参基因是Actin5C;蜂王腹神经索中EF-1α最稳定;雄蜂储精囊中最稳定的内参为S18。【结论】熊蜂内参基因的稳定性因熊蜂级型及组织而异。因此,在进行熊蜂相关基因表达研究时需要根据样本特性选择更稳定的内参基因,以确保结果的可靠性。

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