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水稻ENOD93基因家族的全基因组鉴定与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李固梓 1 ; 刘群恩 1 ; 陈代波 1 ; 于萍 1 ;

作者机构： 1.中国水稻研究所/浙江省超级稻研究重点实验室

关键词： 水稻;ENOD93基因家族;基因鉴定;生物信息学;逆境胁迫

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2023 年 39 卷 027 期

页码： 95-102

收录情况： CSCD

摘要： 旨在为非豆科植物中早期结瘤素蛋白ENOD93的功能研究提供参考和依据.利用生物信息学方法对水稻中的ENOD93基因家族成员进行鉴定,并对其成员的理化性质、染色体定位、基因结构、蛋白结构、表达谱、进化关系进行分析.结果表明,水稻ENOD93基因家族有7个成员,分布在第2和第6染色体上,基因结构均较简单,而且大部分ENOD93基因在保守结构域和保守基序的分布和排列上具有高度的相似性.RNA-Seq数据分析结果表明,水稻ENOD93基因在雌蕊、种子和胚中高表达,部分基因的表达量还受到逆境胁迫的诱导.利用包含单、双子叶植物的9个物种进行的系统进化关系分析,将31个ENOD93基因家族成员分为4个不同的类群.水稻ENOD93基因在不同组织和不同发育时期的表达存在差异,部分基因受胁迫诱导表达,表明该家族基因参与植物众多组织的发育过程且在逆境胁迫响应中具有重要作用.

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