文献类型： 中文期刊

作者： 王富强 ¹ ; 张建 ² ; 温常龙 ² ; 樊秀彩 ¹ ; 张颖 ¹ ; 孙磊 ¹ ; 刘崇怀 ¹ ; 姜建福 ¹ ;

作者机构： 1.中国农业科学院郑州果树研究所

2.北京市农林科学院北京蔬菜研究中心

关键词： 葡萄;KASP标记;品种鉴定;指纹图谱;遗传多样性分析

期刊名称： 中国农业科学

ISSN：

年卷期： 2021 年 013 期

页码： 2830-2846

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】开发一组能够区分中国主栽葡萄品种的竞争性等位基因特异性PCR（KASP）分子标记,为中国葡萄品种保护、品种登记和市场维权等提供技术支撑。【方法】基于前人筛选的60个葡萄高多态性SNP位点,转化为KASP标记。分别使用23份代表性品种和76份主要栽培品种对转化成功的KASP标记进行初筛、复筛、验证,获得一组高质量的KASP标记,并用于构建76份葡萄品种的DNA指纹图谱。【结果】60个SNP位点有3个不具备基因组特异性,6个无法设计KASP-PCR引物,最终51个SNP成功转化为KASP标记,转化率达到89.47%。利用LGC-SNPline平台对23份代表性品种进行基因分型,51个KASP标记全部成功分型。基于次要等位基因频率（MAF）大于0.25、多态性信息含量（PIC）大于0.35、缺失率小于0.2、杂合率小于0.6等参数,初步筛选出27个优质KASP标记。使用构建指纹图谱的76份品种复筛出22个高质量KASP标记。22个KASP标记的缺失率均小于0.12,PIC均大于0.3,杂合率在0.4—0.6的标记占77.27%,MAF大于0.3的标记占95.45%。此外,利用这22个标记对同一品种不同树体提取的23份代表性品种的DNA扩增检测,前后两次检测分型结果稳定一致,表明这22个标记具有较好的重复性和稳定性。进一步将基于22个标记获得的76份葡萄品种分型结果转化为二元编码数据,得到76份葡萄品种的指纹图谱。经邻接聚类分析和群体结果分析,可将76份葡萄品种分为3类,并能正确区分二倍体和多倍体。仅用10个标记（VIT₁5₁8567587、VIT₆₄258638、VIT₈₃320936、VIT₁2₂2228357、VIT₁1₁9390306、VIT₁6₁7950801、VIT₁8₁1138668、VIT₁2₇39916、VIT₁6₁3454358、VIT₁6₂1202286）就能区分70份品种,其中有54份品种达到品种鉴定的标准（差异位点数≥2）。【结论】从60个葡萄SNP中成功转化51个KASP标记,并筛选出22个高质量KASP标记,构建了76份葡萄品种的SNP指纹图谱,首次验证了KASP技术在我国葡萄品种鉴定中的可行性。