文献类型: 中文期刊
作者: 李俊 1 ; 宋娟娟 1 ; 周映君 2 ; 李国庆 1 ; 张静 1 ;
作者机构: 1.华中农业大学植物科学技术学院
2.中国农业科学院麻类研究所
关键词: 灰葡萄孢;鞘氨醇羟化酶;基因克隆;基因表达;菌核形成;功能
期刊名称: 植物保护学报
ISSN: 0577-7518
年卷期: 2022 年 49 卷 004 期
页码: 1046-1052
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为明确灰葡萄孢Botrytis cinerea鞘脂代谢通路基因Bcsphl1的生物信息学特征及其在菌核发育中的潜在功能,采用CTAB法和Trizol法提取灰葡萄孢菌丝、菌核的gDNA和总RNA,利用PCR技术克隆其BcSphl1基因,运用生物信息学软件对其进行鉴定和分析,并利用半定量反转录-聚合酶链反应(semi-quantitative reverse transcription and polymerase chain reaction,SqRT-PCR)技术测定其在灰葡萄孢菌核不同形成阶段的表达情况.结果表明:Bcsphl1基因序列全长1 833 bp,编码360个氨基酸;Bcsphl1基因编码蛋白的分子质量为40.94 kD,理论等电点为7.73,分子式为C1889H2868N4920507S11,不稳定系数为31.19,脂肪指数为100.47,亲水性平均指数为0.160,属于结构稳定的疏水性蛋白.该基因编码的蛋白质无信号肽,定位于细胞质膜,含有3个跨膜结构域和1个脂肪酸羟化酶保守结构域.氨基酸序列同源性比对发现Bcsphl1氨基酸序列与灰葡萄孢T4菌株鞘氨醇羟化酶类蛋白的一致性达98.23%.Bcsphl1基因在灰葡萄孢菌核形成初期(6 d)、中期(9 d)和后期(12 d)均有较高水平表达,其中在中期表达水平最高,表明其可能参与灰葡萄孢菌核形成的调控.
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