您好,欢迎访问云南省农业科学院 机构知识库!

苦荞FtHCT的基因克隆与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨晓琳 1 ; 段迎 1 ; 蔡苏云 1 ; 贺润丽 1 ; 尹桂芳 2 ; 王艳青 2 ; 卢文洁 2 ; 孙道旺 2 ; 王莉花 2 ;

作者机构: 1.山西中医药大学中药与食品工程学院

2.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室

关键词: 苦荞;HCT;基因克隆;生物信息学;表达分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2023 年 001 期

页码: 102-109

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究克隆木质素生物合成途径关键酶莽草酸/奎宁酸羟基肉桂酰转移酶(HCT),探究苦荞HCT基因的表达调控以及对苦荞果壳发育形成的影响。运用RT-PCR技术克隆获得两条苦荞HCT基因,命名为Ft HCT-1、FtHCT-2,对两基因编码蛋白进行生物信息学分析,对不同组织器官及果壳不同时期混合材料进行RT-qPCR表达分析。结果表明:FtHCT-1、FtHCT-2开放阅读框序列长度分别为1 347、1 278 bp,各编码448和425个氨基酸,蛋白分子量分别为49.66和46.57 kD,理论等电点为5.72和6.64,均为亲水性蛋白,处在细胞质内,均属于PLNO2481和Trasferase超家族,具有高度同源。两基因表达存在明显差异。本研究克隆所得两条HCT基因在苦荞果壳生长发育中特定表达,推断其表达影响苦荞果壳木质素合成,为薄果壳形成的关键基因。

  • 相关文献

[1]苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析. 杨晓琳,段迎,蔡苏云,贺润丽,尹桂芳,王艳青,卢文洁,孙道旺,王莉花. 2022

[2]蓖麻GRF转录因子家族生物信息学鉴定及表达分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2021

[3]蒜芥茄SsVe1和SsVe2基因的克隆及表达分析. 吴丽艳,尹梦莹,念润,黎志彬,鲍锐,董相书,龚亚菊,杜光辉. 2021

[4]中华蜜蜂气味结合蛋白基因AcerOBP14的克隆及时空表达. 杜亚丽,张中印,潘建芳,王树杰,杨爽,赵慧婷,姜玉锁. 2016

[5]甘蔗HD-Zip Ⅰ亚家族转录因子基因ScGT1的克隆和生物信息学分析. 李旭娟,李纯佳,林秀琴,刘洪博,徐超华,字秋艳,毛钧,陆鑫,刘新龙. 2019

[6]峨眉蔷薇Ro-DREB1C的克隆与生物信息学分析. 周宁宁,王俊云,李淑斌,陈敏,张颢,王其刚. 2018

[7]峨眉蔷薇Ro-DREB1C的克隆与生物信息学分析. 周宁宁,王俊云,李淑斌,陈敏,张颢,王其刚. 2018

[8]云南特有火把梨UFGT基因片段的克隆与序列分析. 孟富宣,周军,王大玮,陶磅,董娇,徐世宏,段淋渊. 2016

[9]滇龙胆草7-脱氧番木鳖酸-7-羟化酶基因的克隆与表达分析. 张晓东,李彩霞,王元忠. 2019

[10]滇龙胆甲羟戊酸激酶基因的克隆与表达分析. 张晓东,李彩霞,赵静,杨娇,王元忠. 2015

[11]茶树冷诱导基因RAV的克隆与表达特性分析. 陈林波,李叶云,王琴,高永亮,江昌俊. 2010

[12]滇牡丹PdANR基因克隆及表达模式分析. 杜春,平怀磊,王文治,张平芳,张怀壁,王娟. 2022

[13]西方蜜蜂Lozenge基因的克隆鉴定及时空表达分析. 黄蕾,朱雅楠,梁立强,李秋方,李正汉卿,林焱,聂红毅,苏松坤. 2023

[14]滇水金凤花斑形成相关基因IuMYB114和IuMYB36的克隆及表达分析. 陶宇蝶,孟丹晨,黄美娟,魏春梅,赵秋燕,周敏,瞿素萍,黄海泉. 2023

[15]滇龙胆香叶醇10-羟化酶基因的克隆与表达分析. 张晓东,李彩霞,李爽,刘倩倩,王元忠,王家金. 2017

[16]紫娟茶树bHLH转录因子MYC1基因克隆及表达分析. 曲浩,刘悦,孙云南,尚卫琼,田易萍,陈林波. 2020

[17]滇龙胆GrCMS基因的克隆与表达分析. 张晓东,李彩霞,王元忠. 2016

[18]滇龙胆乙酰CoA转移酶基因的克隆与表达分析. 张晓东,李彩霞,王连春,王元忠. 2016

[19]茶树抗逆相关基因ERF的克隆与表达特性分析. 陈林波,房超,王郁,李叶云,江昌俊,梁名志. 2011

[20]蒜芥茄SsWRKY1基因克隆及黄萎病病原菌胁迫下表达分析. 尹梦莹,蔚亚楠,杜光辉,桂敏,黎志彬,鲍锐,龚亚菊,吴丽艳. 2022

作者其他论文 更多>>