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苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨晓琳 1 ; 段迎 1 ; 蔡苏云 1 ; 贺润丽 1 ; 尹桂芳 2 ; 王艳青 2 ; 卢文洁 2 ; 孙道旺 2 ; 王莉花 2 ;

作者机构： 1.山西中医药大学中药与食品工程学院

2.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室

关键词： 苦荞;漆酶;基因克隆;生物信息学;表达分析

期刊名称： 作物杂志

ISSN： 1001-7283

年卷期： 2022 年 003 期

页码： 73-79

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用RT-PCR技术从苦荞中克隆出2条漆酶（laccase）基因，运用生物信息学技术对2个基因序列进行分析，预测结构域、二级和三级蛋白结构，进行蛋白同源比对及进化树分析。结果表明，FtLAC-1基因序列开放阅读框为1695bp，编码564个氨基酸，FtLAC-2基因序列开放阅读框为1707bp，编码568个氨基酸。FtLAC-1和FtLAC-2蛋白预测分子量分别为61.41和62.47kDa，理论等电点分别为9.45和9.41，为亲水性蛋白，2个基因序列相似性较低，氨基酸序列同源性不高。qRT-PCR分析出其在苦荞不同组织器官存在差异性表达。结论为进一步探索FtLAC-1和FtLAC-2在苦荞薄果壳形成中的功能提供理论基础。

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