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新型猪流行性腹泻病毒重组体的分子特性

文献类型： 中文期刊

作者： 谷长维 1 ; 胡博 2 ;

作者机构： 1.甫康(上海)健康科技有限责任公司

2.中国农业科学院特产研究所

关键词： 猪流行性腹泻病毒;重组体;系统发育树;分子特性

期刊名称： 中国动物传染病学报

ISSN： 1674-6422

年卷期： 2024 年 32 卷 005 期

页码： 196-201

摘要： 以分离株PEDV/Belgorod/dom/2008的全基因组序列为研究对象，利用MUSCLE软件对GenBank数据库中的18个全基因组PEDV序列、3个传染性胃肠炎病毒(transmissible gastroenteritis virus,TGEV)序列和1个猪肠道冠状病毒序列进行多重比对，通过MEGA 6.0中的极大似然法，基于PEDV M和S基因序列构建系统发育树。结果检测到PEDV/Belgorod/dom/2008的S基因重组事件，全基因组序列两两同一性分析发现，PEDV/Belgorod/dom/2008是PEDV与传染性胃肠炎病毒毒株之间的中间体。表明PEDV/Belgorod/dom/2008是一种新的重组毒株，PEDV/Belgorod/dom/2008与已知的PEDV毒株关系较远。PEDV/Belgorod/dom/2008分离株不属于美国或中国毒株形成的任何类群，并与意大利分离的SeCoV-ITA09重组毒株形成单独的集群。此项研究可用于进一步分析猪流行性腹泻病毒的进化变异性、流行率和流行病学。

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