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白刺14-3-3基因家族的鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 易丹 1 ; 王博 1 ; 段慧荣 2 ; 李毅 1 ; 王丽蓉 3 ;

作者机构： 1.甘肃农业大学林学院

2.中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所

3.青海民族大学

关键词： 14-3-3基因家族;白刺;生物信息学;表达模式

期刊名称： 草地学报

ISSN： 1007-0435

年卷期： 2021 年 003 期

页码： 443-456

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探明白刺（Nitraria tangutorum）14-3-3基因家族的基本特征及其进化关系,本研究基于白刺转录组数据,利用生物信息学方法,对白刺14-3-3基因家族成员进行鉴定,预测其理化性质、亚细胞定位、保守结构域,分析其系统进化关系及其基因在不同浓度盐、干旱处理下的组织器官表达模式。结果表明:从白刺转录组数据中初步筛选出10个14-3-3家族成员,其中具有完整蛋白质编码区（Coding Sequence, CDS）的9个成员,其蛋白的编码氨基酸的数目为212～297个,等电点在4.73～6.14之间,分子量范围是24.06～33.51 kDa,二级结构主要以α螺旋为主,三级结构高度保守;亚细胞定位预测显示该家族成员主要分布在细胞质上;表达模式分析表明,14-3-3基因在白刺不同组织器官中呈现不同的表达规律,且参与应答外界的干旱和盐胁迫。由此推测,14-3-3基因家族可能在白刺的胁迫防御方面发挥重要功能。本研究结果为进一步深入揭示白刺14-3-3基因家族的功能奠定基础。

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