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基于SSILP、InDel和SSR标记的杂草稻籼粳分类

文献类型： 中文期刊

作者： 徐群 1 ; 许红云 2 ; 魏兴华 1 ; 汤圣祥 1 ; 李东宣 2 ; 陈丽娟 2 ;

作者机构： 1.中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室

2.云南农业大学稻作研究所

关键词： 杂草稻;栽培稻;分子标记;籼粳分类

期刊名称： 中国水稻科学

ISSN： 1001-7216

年卷期： 2012 年 26 卷 06 期

页码： 686-692

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用40对SSILP、30对InDel和43对SSR标记对来自斯里兰卡的28份杂草稻和14栽培稻,来自国内外的9份籼型栽培稻、7份粳型栽培稻和4份代表性杂草稻进行遗传多样性分析。SSILP、InDel和SSR标记分别检测到84、61和213个等位基因,其平均多态性信息含量(PIC)分别为0.257、0.255和0.543。聚类分析显示供试的42份斯里兰卡杂草稻和栽培稻均为籼型。SSILP与InDel标记的相关性很高(r=0.989),而它们与SSR标记相关性较低(0.812和0.808)。结果表明,SSILP和InDel标记可高效鉴别各类稻种资源的籼粳属性,而SSR标记更适用于亚种内的分类。

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