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狂犬病毒GSQY-Dog-China-2013株全基因组序列测定和遗传进化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 邢广旭 1 ; 姜中毅 2 ; 焦文强 1 ; 王方雨 1 ; 张改平 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院

2.甘肃省疫病预防控制中心

关键词: 狂犬病病毒;GSQY-Dog-China-2013;全基因组序列测定;遗传进化分析

期刊名称: 中国兽医杂志

ISSN: 0529-6005

年卷期: 2023 年 001 期

页码: 8-13

收录情况: 北大核心

摘要: 为了全面分析我国狂犬病病毒遗传进化情况,本试验使用反转录PCR(RT-PCR)方法将狂犬病病毒GSQY-Dog-China-2013分为10个片段进行扩增,回收目的片段并与pMD20-T simple载体连接,转化JM109感受态细胞,挑取阳性克隆进行测序;使用DNASTAR软件中的Edit Seq通过拼接相邻片段之间的重叠序列获得GSQY-Dog-China-2013全基因组序列,构建系统进化树进行遗传进化分析。结果显示,GSQY-Dog-China-2013全长11 924核苷酸(nt),包含5个开放阅读框,分别编码核蛋白(N)、磷蛋白(P)、基质蛋白(M)、糖蛋白(G)和转录大蛋白(L);基于全基因组序列的进化树分析显示,GSQY-Dog-China-2013株和国内分离株形成一个分支,在国内分离株中与SXYL15株和SXBJ15株形成一个分支,亲缘关系最接近,提示GSQY-Dog-China-2013可能源自我国陕西省。本试验系甘肃省首次报道狂犬病病毒全基因组序列,进一步丰富了我国狂犬病病毒遗传进化数据,为狂犬病全面防治以及疫苗研发提供了数据支持。

  • 相关文献

[1]狂犬病病毒N基因植物表达载体的构建. 张二芹,张东林,马强. 2013

[2]狂犬病病毒糖蛋白胞外区基因的原核表达、纯化及鉴定. 杨艳艳,王丽,杨继飞,郅玉宝,滕蔓,邓瑞广,肖治军,张改平. 2010

[3]狂犬病病毒G蛋白的原核表达及反应原性分析. 王攀,刘运超,魏蔷,柴书军,陈玉梅,张改平. 2017

[4]狂犬病病毒G蛋白在水稻中的表达及遗传稳定性鉴定. 申雪静,张二芹,许倩茹,刘林科,万博,刘运超,孙亚宁,赵东,牛香香,邓瑞广,张改平. 2019

[5]加强我国狂犬病防控. 夏咸柱,俞永新,侯云德,赵铠,曾毅,庄辉,洪涛,陈焕春,刘秀梵,张改平,贾敬敦,刘棋,杨松涛,黄小建. 2011

[6]牛环曲病毒河南分离株的遗传进化分析. 师志海,徐照学,兰亚莉,王文佳. 2019

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