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利用全基因组关联分析挖掘高粱单宁新调控遗传位点

文献类型： 中文期刊

作者： 张丽霞 1 ; 王春语 1 ; 于淼 1 ; 陈冰嬬 1 ; 陆晓春 1 ;

作者机构： 1.辽宁省农业科学院高粱研究所;吉林省农业科学院作物资源研究所

关键词： 高粱;单宁;全基因组关联分析;候选基因

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2023 年 06 期

页码： 1125-1134

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 单宁是高粱重要的籽粒品质性状之一,单宁含量的高低直接影响其用途。调控单宁含量Tan1和Tan2基因虽被克隆,但并不能完全解释高粱籽粒中单宁含量高低的现象,因此调控单宁含量必定还存在其他的新基因。利用300份和202份(去除98份含有tan1-a和tan1-b基因型的材料)自然群体材料的单宁含量表型数据以及重测序获得的4 842 629个SNPs,采用全基因组关联分析方法挖掘调控单宁含量新遗传位点及候选基因。共获得25个显著关联区间、共有40个候选基因,其中Sobic.001G041500和Sobic.006-G180300是bHLH转录因子, Sobic.001G398100和Sobic.001G398200是MYB转录因子, Sobic.002G044200与类黄酮-3′,5′-羟化酶高度同源。类黄酮合成途径是合成单宁的必经过程, 5个候选基因均参与类黄酮合成途径,也可能参与单宁的生物合成。新单宁调控遗传位点及候选基因的挖掘为深入研究高粱单宁调控的遗传机制提供分子依据。

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