下属机构
中国农业科学院水牛研究所
研究主题：畜牧、动物医学、动物遗传育种、动物繁殖、动物营养与饲料、动物疫病防控、农产品加工、奶制品、牛。
简介：中国农业科学院水牛研究所位于广西南宁市，成立于1958年，1960年下放地方进入广西畜牧研究所，1994年重建为“广西壮族自治区水牛研究所”，加挂“中国农业科学院水牛研究所”牌子，是全国惟一对水牛进行专门研究的科研机构，已成为全国最大的良种水牛繁育科技创新中心和技术培训基地，实行中国农业科学院与广西壮族自治区共建，以广西为主的管理体制。主要承担水牛科学研究、科研成果中试、技术开发和推广、种牛培育和服务等任务。研究重点在水牛饲料营养、乳品加工、疾病防治、水牛奶业产业化等5个方面。 【人员组成】现有在职职工120人，其中科技人员72人，高、中级专业技术职务人员29人。
中国农业科学院甘薯研究所
研究主题：农学、薯类作物、甘薯、植物种质资源、植物遗传育种、植物生物技术、植物生理生态与栽培、植物保护、农产品加工、薯类制品、质量检测、小麦、水稻、棉花、蔬菜、油料作物。
简介：中国农业科学院甘薯研究所位于江苏省徐州市，成立于1959年，原为中国农业科学院薯类研究所，1962年并入江苏徐淮地区徐州农业科学研究所，2002年11月加挂“中国农业科学院甘薯研究所”牌子。育种目标由以往以高产为主调整为高产、优质、多抗、专用型品种为主；栽培技术研究从以往高产为主调整为超高产、轻型、高效、安全、集约栽培为主。育种方法由以往系统选育为主过渡到以杂交育种为主、系统选育为辅，启动分子标记生物技术用于辅助育种的研究。
农业部食物与营养发展研究所
研究主题：食品科学、食物营养、农业经济、食物安全。
简介：农业部食物与营养发展研究所是国家食物与营养咨询委员会科研载体和办事机构，其宗旨是为国家保障食物安全供给、优化食物结构、强化居民营养改善、促进食物生产消费营养协调发展、提高国民素质和健康水平提供决策服务。主要职责是：开展食物与营养发展理论、方法、政策及其战略研究，提出政策建议；开展食物数量安全保障体系、食物质量安全保障体系、居民营养改善体系建设及重点产品、重点区域、重点人群研究，推动居民食物结构改善；受委托组织编制国家食物与营养发展纲要，并跟踪反馈推进实施情况，推动纲要贯彻落实；承担国家食物与营养咨询委员会下达的任务及日常工作，组织相关部门、领域的专家开展调查研究；组织、参与全球性、地区性食物安全与营养领域重要活动，构建国际信息网络，开展学术交流与合作；承担研究生、博士后研究人员等高层次人才的培养；编辑出版食物营养简报及研究材料，宣传普及食物安全与营养健康知识；承担法律法规规定和举办单位交办的其他工作。
中国农业科学院深圳农业基因组研究所
研究主题：“农业生物组学”、“系统生物学和合成生物学”、“全基因组设计育种”和“农业宏基因组研究与利用”等4个领域为研究重点，设置了“农业动植物基因组学”等研究方向
简介：深圳农业基因组研究所（Agricultural Genomes Institute at Shenzhen Chinese Academy of Agricultural Sciences, AGIS），成立于2014年4月24日，由中国农业科学院和深圳市合作建设，是目前国内唯一专门从事农业基因组学基础及应用研究的国家级科研机构。本所坚持面向国家重大战略需求和国际农业基因组学研究前沿，经过一年的发展，已形成以农业基因组学技术创新体系为核心，围绕“农业生物组学基础”、“基因组学与动植物育种”、“基因组学与动植物健康”三大主题，辐射农作物、畜牧、资源与环境三大学科集群的学科体系。目前，基因组所已建成国际一流的高通量测序平台（一台Hiseq 3000、一台HiSeq 2500和一台MiSeq）、全国农业科研系统规模最大的超级计算平台和农业生物大数据中心（计算峰值达50万亿次，内存总量超过15 T，硬盘存储量超过2 PB）、以及功能齐全的分子生物学实验平台。农业基因组所位于深圳市大鹏新区高端旅游风景区内，三面环山，一面向海，风景秀美，空气清新。总面积约为 2200亩，包含科研实验楼、行政办公楼、宿舍楼、育苗温室和试验田等完善的配套设施。
中国农业科学院食品科学与技术研究所
研究主题：
简介：中国农业科学院农产品加工研究所是根据科技部、财政部、中编办国科发政字[2002]356号文件精神，在中国农业科学院原子能利用研究所学科调整基础上新组建的研究所，是中国农业科学院下属的唯一从事以食品为主的农产品加工技术研究与开发的国家级科研机构。研究所现拥有农产品质量与食物安全、生物物理学2个博士点，食品科学、农产品加工及贮藏工程2个硕士点和农产品加工与安全专业农业推广硕士学位授权点，有食品化学与营养、食品微生物与发酵工程、功能食品与生物活性物质、食品质量与安全、农产品辐照与贮藏、食品工程和食品生物技术7个重点学科方向，在农产品加工品质分析与评价、粮食与植物蛋白工程、食品质构重组、果蔬变温压差膨化干燥、功能食品开发、食品加工全程质量控制、食品非热力杀菌、食品安全快速检测、食品高效分离提取和食品生物技术等方面具有较好的研究基础和优势。作为本领域唯一的国家级科研机构，肩负着发展农产品加工科学技术、转化技术成果、培养农产品加工高级科研人才、组织全国科研协作、开展国际合作与交流和提供农产品加工政策咨询等使命，“一手抓基础研究，一手抓技术、工艺和产品研制”，开展农产品加工基础性工作、基础研究、高 技术发展、关键技术研究、技术集成、产品研制和标准制定，解决农产品加工业发展中的基础性、方向性、全局性和前瞻性问题，引领我国农产品加工科学技术发展方向，服务农产品加工产业发展，行使国家队职责。
