下属机构
中国农业科学院棉花研究所
研究主题：农学、棉花、植物生物学、植物基因组学、植物生物信息学、植物生物技术、植物遗传育种、植物种质资源、植物生理生态与栽培、植物保护、质量检测。
简介：中国农业科学院棉花研究所于1957年8月在北京成立，1958年3月迁到河南安阳，是唯一的国家级棉花专业科研机构和全国棉花科研中心，以应用研究和应用基础研究为主，组织和主持全国性的重大棉花科研项目，着重解决棉花生产中的重大科技问题，开展国际棉花科技合作与交流，培养棉花科技人才，宣传推广科研成果与先进的植棉技术。
中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所
研究主题：畜牧、草食动物、动物遗传育种、动物繁殖、草业科学、饲料学、动物医学、动物疫病防控、中兽医、兽药、畜产品、毛皮制品、质量检测。
简介：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所位于甘肃省兰州市，前身是成立于1946年的国立西北畜牧兽医学院，1996年11月由原中国农业科学院中兽医研究所与中国农业科学院兰州畜牧研究所合并成立。主要从事兽药创新、草食动物育种与资源保护利用、中兽医药现代化、旱生牧草品种选育与利用研究等应用基础研究和应用研究。
中国农业科学院特产研究所
研究主题：畜牧、特种经济动物、观赏动物、动物生物学、动物生物技术、动物饲养管理、动物繁殖、预防兽医学、动物疫病防控、动物疫病诊断、兽医生物制品、药用植物、特种经济植物、野生动植物、质量检测。
简介：中国农业科学院特产研究所位于吉林省吉林市，前身是始建于1956年的吉林省特产试验站，1981年定名为中国农业科学院特产研究所，是全国唯一的国家级专业从事特种动植物资源保护、开发、利用的综合性科研机构。以特种经济动植物为主要研究对象，围绕发掘、利用、保护珍贵、稀有、经济价值高的野生动植物资源，以家养、家植应用技术研究为主，深入开展应用基础和开发研究。
中国农业科学院农产品加工研究所
研究主题：农产品加工、食品科学、粮食制品、油脂制品、功能食品、肉制品、奶制品、果制品、蔬菜制品、保鲜与贮藏、农产品物流、农产品质量安全、质量检测。
简介：中国农业科学院农产品加工研究所位于北京市，建所于2003年12月，前身是中国农业科学院原子能利用研究所，本领域唯一的国家级科研机构。拥有食品科学研究中心、食品安全实验室、辐照中心和质检中心等科研设施。主要开展食品质量与安全、功能食品与生物活性物质、食品化学与营养等重点学科方向的研究工作。有农产品加工技术与工程、农产品保鲜与物流、食品质量与安全等3个一级学科，以及农产品质量与食物安全、生物物理学2个博士点。
中国农业科学院农业经济与发展研究所
研究主题：农业经济、农村经济、农业技术经济、资源与环境经济、种植业经济、畜牧业经济、农产品贸易、食物安全。
简介：中国农业科学院农业经济与发展研究所位于北京市，成立于1958年，前身为中国农业科学院农业经济研究所，是我国最早成立的专门从事农业经济研究的国家级公益性科研机构。主要任务是以农村生产力经济为主要研究对象，侧重研究农村经济发展战略、农业技术经济与政策、农产品流通与国际贸易、农村能源与环境经济、食物安全政策、农村贫困问题、农业科技政策与农业推广、农业现代化、区域发展、农业企业发展战略等。是中国农业经济学会、中国农业技术经济研究会的挂靠单位。农经所是新中国成立后最早、专门从事农业经济研究的国家级公益性科研机构，其主要任务是以农村生产力经济为主要研究对象，侧重研究农村经济发展战略、农业技术经济与政策、农产品流通与国际贸易、农村能源与环境经济、食物安全政策、农村贫困问题、农业科技政策与农业推广、农业现代化、区域发展、农业企业发展战略等重大问题，为国家及各级政府制定农业政策提供决策依据，为农业企业发展提供咨询；培养农业经济方面的高级人才；开展国内外的学术交流与合作；编辑出版全国性的专业刊物《农业经济问题》和《农业技术经济》。同时，农经所还是全国农业科研系统农业经济研究交流和信息中心、两个一级学会—中国农业经济学会和中国农业技术经济研究会的挂靠单位。2003年1月制定的《中国农业科学院农业经济与发展研究所改革方案》提出，研究所未来的发展方向是“三面向、三加强”，即面向全面建设农村小康社会的需求、面向国际农业经济研究的前沿、面向市场的需要；加强农业公共政策创新、加强农业经济理论和研究方法的创新、加强基础资料的保存、整理和政策研究平台的建设。目标是逐步建设成为国际知名的国家级非营利性农业经济研究机构，形成全国农业经济与政策的创新中心和国际交流中心。
中国农业科学院农业信息研究所
研究主题：农业信息技术、农业信息管理、农业信息分析、农业信息系统、农业监测预警、智能农业技术、精准农业、农业信息资源建设、农业经济、农产品供求与市场、食物安全
简介：中国农业科学院农业信息研究所由1957年成立的中国农业科学院情报所和图书馆、1981年成立的计算中心、1992年成立的宏观室等独立研究机构逐步合并而成，2005年正式更用现名。是以农业信息学科研究和提供农业科技文献与信息为主要任务的国家级非营利性科研机构，主要开展农业信息技术、农业信息管理、农业信息分析三大学科的科学研究，是全国农业文献信息收藏、加工、分析的国家级科技图书文献中心。拥有国家唯一重点支持的国家农业图书馆，现有馆藏文献210万余册，33万余种，其中外文原版现刊2500余训；40余种中外文网络数据库，涵盖了外文电子期刊3500余种、中文电子期刊8000余种。是中国农学会科技情报分会、中国农学会农业图书馆分会、中国农学会计算机分会、中国农学会持续农业分会、中国农学会食物与营养专业委员会、中国农业现代化研究会的挂靠单位。
中国农业科学院生物技术研究所
研究主题：农学、植物生物技术、动物生物技术、应用微生物、植物基因组学、植物遗传育种、生物化学与分子生物学、转基因生物安全、质量检测。
简介：中国农业科学院生物技术研究所位于北京市，成立于1986年6月，前身是中国农业科学院生物技术研究中心，1999年更名为现名，是目前我国唯一一所以农业生物技术前沿基础和应用基础研究为重点的国家级非营利性科研机构。重点开展了作物分子育种技术、生物反应器技术、植物功能基因组与分子生物学、特殊微生物资源与功能基因组学、微生物酶工程技术和转基因生物安全评价技术六大方面的研究工作。在海南三亚、北京平谷和河北廊坊等地建立了田间示范基地。
中国农业科学院饲料研究所
研究主题：畜牧、动物营养与饲料、水产动物营养与饲料、饲料学、饲料生物技术、应用微生物、畜牧业经济、质量检测。
简介：中国农业科学院饲料研究所位于北京市，成立于1991年2月，以开展饲料科技创新和推动饲料行业科技进步为宗旨，是集饲料科学研究、成果转化与推广、人才培养于一体的现代化国家级研究所。主要开展饲料生物技术、饲料添加剂、畜禽水产饲料与营养、饲料与食品安全、饲料资源开发与评价利用、饲料工程技术、饲料经济信息等方面的研究。拥有饲料安全评价基准实验室、饲料工艺标准参考实验室、饲料中药物准实验室、国家转基因生物饲用安全评价与检测中心、国家水产饲料安全评价基地等创新平台。
中国农业科学院郑州果树研究所
研究主题：园艺、园艺作物、植物生物学、植物生物技术、植物种质资源、植物遗传育种、植物繁殖、植物生理生态与栽培、保鲜与贮藏、农产品加工、果制品、农产品质量安全、葡萄、桃、西甜瓜、质量检测。
简介：中国农业科学院郑州果树研究所成立于1960年3月，位于河南省郑州市。主要开展果树瓜类种质资源、遗传育种、生理栽培、果品质量安全控制、果品贮藏加工等研究工作，力争将研究所建成国内领先的果树瓜类科技创新基地、国内一流的果树瓜类成果转化基地，国内知名的果树瓜类信息交流和人才培训基地。
中国农业科学院油料作物研究所
研究主题：农学、油料作物、油菜、大豆、植物生物学、植物基因组学、植物遗传育种、植物生物技术、植物种质资源、食品科学、农产品加工、植物保护、油脂制品、生物质能源、质量检测。
简介：中国农业科学院油料作物研究所建于1960年，位于武汉，前身为中南农业科学研究所和华中农业科学研究所。针对我国油料产业发展中的重大科学与技术问题，重点开展油菜、大豆、花生、芝麻及其他特种油料作物种质资源、遗传育种、功能基因组、基因工程、栽培生理、植物营养与施肥、植物保护、转基因安全性评价、品质化学分析、质量监测和产品加工等领域的研究与技术开发。
