棉花基因组中赤霉素氧化酶基因的鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵亮

作者： 赵亮;狄佳春;陈旭升

作者机构：

关键词： 棉花;赤霉素;赤霉素氧化酶;基因家族

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2020 年 36 卷 03 期

页码： 553-560

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据赤霉素氧化酶氨基酸序列的保守结构域和生物学信息,对棉花2个二倍体野生种(A基因组的亚洲棉和D基因组的雷蒙德氏棉)和2个异源四倍体遗传标准系(陆地棉TM-1和海岛棉H7124)进行了全基因组的查找。结果表明,在2个二倍体野生种的A和D基因组中分别预测到219和188个该酶类基因家族成员;在异源四倍体陆地棉TM-1和H7124中分别预测到了310和428个该酶类基因家族成员。通过分析陆地棉中预测到的310个该酶类基因家族成员在赤霉素敏感超矮突变体和野生型转录组中表达差异,发现16个基因具有显著性差异。利用这16个基因编码的蛋白质氨基酸序列与报道的拟南芥赤霉素氧化酶氨基酸序列进行进化分析,结果表明Gh_D06G2009属于GA3ox氧化酶,Gh_D01G0300和Gh_D09G0746为GA2ox氧化酶,Gh_A06G1341、Gh_A07G1653、Gh_A11G1416、Gh_A13G0444、Gh_A13G1787、Gh_A13G2343、Gh_D01G0055、Gh_D07G0446、Gh_D07G1858、Gh_D08G2680、Gh_D11G3415、Gh_D13G0516、Gh_D13G2157为GA20ox氧化酶。

分类号： S562

  • 相关文献

[1]棉花基因组中SABATH甲基转移酶 基因家族的查找与分析. 赵亮,狄佳春,陈旭升. 2018

[2]棉花基因组中SABATH甲基转移酶基因家族的查找与分析. 赵亮,狄佳春,陈旭升. 2018

[3]棉花中HD-Zip Ⅳ家族基因的全基因组鉴定及特征分析. 王瑞,朱伟王瑞,鲁丽丽,刘拓,章志强,马宗斌,李伶俐,刘伟,杨作仁. 2017

[4]棉花SRS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 张雪,孙瑞斌,马聪聪,马丹,张晓睿,刘志红,刘传亮. 2022

[5]棉花β-半乳糖苷酶基因家族的全基因组鉴定及分析. 曹晓聪,张朝军,苟浩琦,王小艳,乔凯凯,马启峰,张桂寅,范术丽. 2021

[6]甘蔗赤霉素氧化酶基因ScGA20ox1的克隆及功能分析. 周慧文,丘立杭,黄杏,李强,陈荣发,范业赓,罗含敏,闫海锋,翁梦苓,周忠凤,吴建明. 2022

[7]蓖麻赤霉素氧化酶基因的全基因组鉴定和表达分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2022

[8]转EPSPS基因抗除草剂棉花在杂交制种中的应用初探. 高明伟,王秀丽,张超,陈莹,姜辉,王家宝,柴启超,王永翠,赵军胜. 2018

[9]棉花赤霉素合成酶基因在中571的差异表达研究. 石建斌,石建斌,王宁,周红,许庆华,乔文青,严根土. 2018

[10]棉花种子发芽过程中生理生化变化及赤霉素(GA3)的调节. 王宏,王宏,项时康. 1997

[11]棉花中赤霉素和脱落酸的时空变化. 齐海坤,齐海坤,严根土,王宁,杨杰,黄群. 2016

[12]陆地棉中赤霉素合成途径关键酶基因的时空表达变化. 石建斌,王宁,周红,许庆华,乔文青,严根土. 2018

[13]赤霉素对棉花叶片衰老相关基因表达的影响. 王丹,范术丽,宋美珍,庞朝友,喻树迅. 2011

[14]棉花种子发芽过程中生理生化变化及赤霉素(GA3)的调节:Ⅲ胚根的发育及侧根的发生. 王宏,项时康,陈建华,姜瑞云. 1997

[15]不同生态条件下棉花赤霉素合成代谢途径关键酶基因差异表达分析. 石建斌,王宁,周红,许庆华,乔文青,严根土. 2019

[16]蝴蝶兰MYB家族基因鉴定及应对病毒的表达响应. 蒋卉,张晶,袁欣,符真珠,高杰,董晓宇,王慧娟,李艳敏,王利民,张和臣. 2018

[17]粗山羊草Dof转录因子家族基因的鉴定与分析. 赵梦琪,周正富,齐豫川,晁岳恩,王美芳,何盛莲,李文旭,秦毛毛,吴政卿,雷振生. 2017

[18]马铃薯扩展蛋白基因家族的鉴定与表达分析. 理向阳,代丹丹,杨铁钢,郝西. 2017

[19]乌拉尔图小麦NBS-LRR家族生物信息学分析. 刘小芳,袁欣,聂迎彬,张晶. 2018

[20]黄瓜扩展蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析. 郝西,理向阳,腊贵晓,代丹丹,杨铁钢. 2015

作者其他论文 更多>>

微信小程序