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玉米ZmCPB1基因的克隆、表达及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘江 1 ; 赵兴华 1 ; 韩斌 1 ; 王铭 1 ; 路贵和 1 ; 王长彪 1 ; 李新征 2 ;

作者机构: 1.山西省农业科学院生物技术研究中心

2.山东农业大学生命科学学院

关键词: 玉米;ZmCPB1基因;子粒发育;克隆;生物信息学

期刊名称: 玉米科学

ISSN:

年卷期: 2021 年 002 期

页码: 43-49

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 从玉米中克隆ZmCPB1基因的cDNA序列,全长1 446 bp,编码481个氨基酸,蛋白质理论分子量为54.05 KD,等电点为8.59。生物信息学分析表明,ZmCPB1蛋白N端有跨膜结构,是跨膜蛋白。蛋白质二级结构含有48.44%的α-螺旋、4.99%的β-转角、10.60%的延伸链以及35.97%的无规则卷曲,该蛋白定位于内质网中。序列比对结果显示,ZmCPB1蛋白含有与子粒发育相关的保守区VKFVHRKALK。系统进化树分析表明,该蛋白与高粱、谷子、水稻和大麦的同源蛋白亲缘关系最近,同属一个亚支。实时荧光定量PCR分析ZmCPB1基因的表达模式,结果表明,ZmCPB1基因在3叶期的根、茎、叶以及雄穗和苞叶中表达量较低,在雌穗中的表达量较高。在玉米子粒发育的不同时期,ZmCPB1基因的表达量呈现一定的规律变化,在授粉后0~10 d,表达量逐渐达到最高峰,之后开始下降,在授粉15 d后降到较低水平。初步判断ZmCPB1基因与玉米子粒早中期发育有关。

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