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谷子GRF基因家族鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张立全 1 ; 张浩林 1 ; 李丛丛 1 ; 姚磊 1 ; 魏建华 1 ; 张杰伟 1 ;

作者机构： 1.北京市农林科学院农业生物技术研究所农业基因资源与生物技术北京市重点实验室

关键词： 谷子;GRF;基因家族;进化分析;磷酸化

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2021 年 011 期

页码： 2340-2347

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】系统分析谷子GRF基因家族在谷子中如何发挥作用。【方法】基于谷子基因组数据库和生物信息学方法,鉴定谷子GRF基因家族的基因结构、基本特征、编码蛋白结构和潜在的磷酸化位点,并以序列比对进行系统进化分析。【结果】谷子含有10个GRF基因,含有2～4个外显子,分布于谷子第1、2、4、7、8和9号染色体上。MEME保守基序分析显示,谷子GRF蛋白均含有保守的QLQ（PF08880）和WRC（PF08879）结构域。磷酸化位点分析表明谷子GRF蛋白均含有大量的潜在磷酸化位点。【结论】为今后揭示谷子GRF蛋白的功能及其翻译后修饰提供重要参考。

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[8]近30年我国谷子生产时空变化与区域优势研究. 刘杰安,王小慧,吴尧,贾浩,尹小刚,史磊刚,褚庆全,陈阜. 2019

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