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毛白杨BABY BOOM基因的克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨紫彤 1 ; 姜廷波 2 ; 魏建华 3 ; 丁莉萍 3 ;

作者机构: 1.东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室

2.东北林业大学

3.北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心农业基因资源与生物技术北京市重点实验室

关键词: 毛白杨;BBM基因;克隆;生物信息学

期刊名称: 植物生理学报

ISSN: 2095-1108

年卷期: 2021 年 011 期

页码: 2155-2166

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: BBM (BABY BOOM)转录因子是植物细胞全能性和胚胎发生的关键调控因子。利用PCR技术从毛白杨‘BJHR01’幼叶cDNA中克隆得到PtoBBM1和PtoBBM2基因,利用生物信息学软件,对这两个基因的序列和功能进行分析。结果表明:毛白杨中PtoBBM1蛋白与毛果杨中PtrBBM1 (B9HHX9)蛋白相似性高达96%; PtoBBM2与PtrBBM2 (B9HYI0)蛋白相似性达到98%。此外, PtoBBM1和PtoBBM2蛋白均含有2个AP2保守结构域,三级结构预测它们均和乙烯反应性转录因子ERF096模型高度相似。理化性质分析推测PtoBBM1和PtoBBM2均是不稳定的亲水蛋白,不具有信号肽,亚细胞定位预测PtoBBM1和PtoBBM2蛋白均定位于细胞核,都具有跨膜结构。进化树分析显示,杨树BBM与蓖麻、棉花BBM归为一个分支,亲缘关系较近。组织表达分析表明, PtoBBM1主要在根中表达,叶和茎中表达量较低; PtoBBM2主要在叶和根中表达,茎中表达量较低, 2个同源基因表达具有组织部位的差异性。在胚性愈伤组织形成过程中,PtoBBM1和PtoBBM2基因均在胚性愈伤组织形成期表达量最高,说明PtoBBM1和PtoBBM2基因可能在杨树胚性愈伤组织形成中发挥作用。

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