文献类型： 会议论文
第一作者： SHEN Man-man
作者： SHEN Man-man 1 ; 沈曼曼 2 ; 曲亮 1 ; QU Liang 1 ; WANG Xing-guo 1 ; 王星果 1 ; MA Meng 1 ; 马猛 1 ; DOU Tao-cun 1 ;
作者机构： 1.江苏省家禽科学研究所,江苏扬州 225216
2.扬州大学,江苏扬州 225009
关键词： 鸡;卵泡颗粒细胞;环状RNA;竞争性内源RNA
会议名称： 第十九次全国家禽学术讨论会
主办单位： 中国畜牧兽医学会
页码： 00000069-00000072
摘要： 本研究基于竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)假说,旨在研究环状RNA(cicular RNA,circRNA)circTOX2的潜在功能并对其进行探讨分析.根据circTOX2的序列信息预测结合的miRNA,并利用targetScan和miRDB预测miRNA的靶基因.由两种方法预测的靶基因取交集后进行GO和KEGG功能富集分析,预测circTOX2可能的作用机制.结果表明:circTOX2可以结合5个miRNA(miR-140-3p、miR-1464、miR-1556、miR-1648-3p和miR-1614-3p),集中结合的区域在140-162nt之间,5个miRNA分别预测到的靶基因数量分别为55、55、31、13和81个.对靶基因的并集进行GO和KEGG分析,发现与神经发育的诸多条目中有注释,并富集到肌动蛋白细胞骨架、Wnt信号通路、细胞内吞等多个通路.预测到最重要的靶基因为CDC42,结果提示circTOX2可能通过海绵吸附miR-140-3p靶向CDC42来调控卵泡颗粒细胞的发育.
分类号： S831.1
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