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circFOXP4通过结合miR-24-3p的功能预测分析

文献类型： 会议论文

第一作者： SHEN Man-man

作者： SHEN Man-man 1 ; 沈曼曼 2 ; QU Liang 1 ; 曲亮 1 ; MA Meng 1 ; 马猛 1 ; DOU Tao-cun 1 ; 窦套存 1 ;

作者机构： 1.江苏省家禽科学研究所,扬州,225216

2.扬州大学,扬州,225009

关键词： 蛋鸡;繁殖过程;环状RNA;miR-24-3p靶基因;调控机制

会议名称： 江苏省畜牧兽医学会首届“青年科技论坛”

主办单位： 江苏省畜牧兽医学会

页码： 00000290-00000298

摘要： 本研究基于竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)假说,旨在研究环状RNA(cicular RNA,circRNA)circFOXP4的潜在功能并对其进行探讨分析.根据circFOXP4序列信息预测结合的miRNA,并利用targetScan和miRDB预测miRNA的靶基因,利用文献追踪法筛选出候选miRNA——miR-24-3p,对miR-24-3p靶基因进行进行GO和KEGG功能富集分析,以预测circFOXP4可能的作用机制.结果表明,circFOXP4可以结合14个miRNA,在序列各段均有结合位点;miR-24-3p通过两种预测方法共预测到304个靶基因,两种软件中相同的基因有32个,其中基因PRKCH、MXI1均有实验证明是miR-24-3p靶基因;功能富集分析结果显示circFOXP4通过miR-24-3p介导的靶基因在信号传导、激酶活性、核苷结合、MAPK级联反应等条目中显著富集,在MAPK信号通路、TGF-beta、FOXO等通路中富集,其中KIF3B、MAPK1基因在多个条目或通路中均有富集.结果提示circFOXP4可能通过结合miR-24-3p,降低其发生,促进卵泡颗粒细胞的增殖.

分类号： S831.3

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