文献类型： 中文期刊
作者： 张格阳 1 ; 李玉龙 1 ; 朱肖亭 1 ; 张志杰 1 ; 翟亚莹 1 ; 牛欣然 2 ; 黄永震 3 ; 曾滔 4 ; 张子敬 1 ; 施巧婷 1 ; 王二耀 1 ; 吕世杰 1 ;
作者机构： 1.河南省农业科学院畜牧兽医研究所/河南省畜禽繁育与营养调控重点实验室
2.河南农业大学
3.西北农林科技大学动物科技学院
4.新疆哈密市畜牧工作站
关键词： 郏县红牛;安格斯牛;转录组;肌肉;候选基因
期刊名称： 畜牧与兽医
ISSN： 0529-5130
年卷期： 2023 年 55 卷 005 期
页码： 14-20
收录情况： 北大核心
摘要： 旨在通过转录组学分析筛选出影响牛肌肉发育的候选基因.对5头18月龄的郏县红牛背最长肌进行转录组测序,获得转录组数据后与3头18月龄安格斯牛背最长肌的转录组数据(GSE57327)进行联合分析.结果:与安格斯牛相比,郏县红牛背最长肌中4 945个基因表达显著上调(FDR<0.05),2 186个基因显著下调(FDR<0.05).GO功能富集分析显示差异基因主要富集在与代谢相关生物学过程中.KEGG信号通路分析显示差异表达的基因主要富集到氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)等通路上.从氧化磷酸化通路中筛选出两品种间差异表达最显著的20个基因,通过反刍动物基因组数据库(ruminant genome database,RGD)查看该20个基因的组织表达情况,其中泛素-细胞色素c还原酶复合物Ⅲ亚基Ⅺ(UQCR11)、细胞色素c氧化酶亚基7A1(COX7A1)、细胞色素c铜伴侣蛋白(COX17)、NADH氢酶辅酶Q铁硫蛋白5(NDUFS5)和线粒体ATP酶合成体ε亚基(ATP5F1E)这5个基因在牛骨骼肌组织中的表达量高于其他组织,推测这5个基因在牛的生长发育过程中可能发挥重要作用,可作为候选基因进行进一步验证.
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