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滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶基因的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张海晨 1 ; 李彩霞 1 ; 王元忠 2 ; 张晓东 1 ;

作者机构： 1.玉溪师范学院资源环境学院

2.云南省农业科学院药用植物研究所

关键词： 滇龙胆;1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶;生物信息学;表达模式

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2016 年 32 卷 04 期

页码： 128-136

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在克隆滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶基因GrDXS,并进行表达分析。以滇龙胆转录组为基础,采用RTPCR技术从滇龙胆幼叶克隆GrDXS基因,并进行原核表达和组织特异性表达分析。滇龙胆GrDXS基因(登录号:KJ624995)全长2145bp,编码714个氨基酸;GrDXS蛋白相对分子质量76.75kD,pI为6.93;属于DXS家族成员,可能定位于叶绿体;主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;具有DXS蛋白的4类保守结构域:焦磷酸硫胺素结合折叠域(IPR029061,69-425、366-555、87-268、315-407、407-558)、类转酮酶嘧啶结合结构域(IPR005475,394-559、394-555)、转酮酶C端/丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶结构域II(IPR009014,568-704,572-704)、转酮酶C端结构域(IPR005476,573-696)和1个转酮酶结合位点(IPR020826,500-516);与长春花CrDXS蛋白亲缘关系最近;GrDXS基因在大肠杆菌中表达的重组蛋白相对分子质量约为100kD,与预期蛋白大小一致;GrDXS基因主要在叶中表达。

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