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苜蓿属不同物种叶绿体基因组结构比较及亲缘关系分析

文献类型: 中文期刊

作者: 田春育 1 ; 李志勇 1 ; 刘倩 1 ; 于林清 1 ; 武自念 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院草原研究所

关键词: 苜蓿属;叶绿体全基因组;结构变异;系统发育

期刊名称: 中国草地学报

ISSN: 1673-5021

年卷期: 2021 年 010 期

页码: 1-8

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以苜蓿属24个种1个亚种叶绿体基因组为研究对象,利用REPuter、mVISTA和MAFFT等分析叶绿体基因组的重复序列、序列变异情况及进化关系。结果表明,苜蓿属不同种间叶绿体基因组介于121313~132269bp之间,编码110~118个基因,基因数目的差异主要是因蛋白编码基因数目不一所致。在苜蓿叶绿体基因组中共检测出49~59个重复序列,鉴定出139~163个SSR位点且单碱基重复居多数。序列多样性比对表明,非编码序列在各物种间的差异性较大。此外,筛选到2个核苷酸多样性较高的基因,即clpP和ycf1。通过Maximum likelihood(ML)构建的系统发育树表明,Medicago edgeworthii(毛荚苜蓿)、Medicago archiducis-nicolai(青海苜蓿)和Medicago ruthenica(扁蓿豆)亲缘关系较近。

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