您好,欢迎访问中国农业科学院 机构知识库!

黄芪属物种叶绿体基因组蛋白编码基因密码子偏好性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李事超 1 ; 赵诚贵 2 ; 姜永成 3 ; 武自念 4 ; 田春育 4 ; 马晖玲 1 ;

作者机构: 1.甘肃农业大学草业学院

2.内蒙古乌兰察布市凉城县农牧和科技局

3.内蒙古兴安盟林业和草原工作站

4.中国农业科学院草原研究所

关键词: 黄芪属;叶绿体基因组;密码子使用偏好性;选择影响;进化发育;最优密码子;系统发育分析

期刊名称: 草业科学

ISSN: 1001-0629

年卷期: 2025 年 42 卷 006 期

页码: 1449-1460

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为阐明黄芪属(Astragalus)物种叶绿体基因组密码子特征及其进化压力,本研究以黄芪属36个物种叶绿体基因组CDS序列为研究对象,对其碱基组成、密码子适应指数、密码子使用偏好性、密码子偏性指数、最优密码子使用频率、有效密码子数及其之间的相关性进行了一系列分析,并利用平均值及标准差的方式对53个蛋白编码基因的遗传多样性进行了评价。结果表明,黄芪属物种叶绿体基因组密码子倾向使用以A/U结尾的密码子,且自然选择为影响密码子使用的主要因素,突变压力也会对其产生影响。研究结果可为黄芪属物种的进化和系统发育提供参考。

  • 相关文献

[1]扁蓿豆叶绿体基因组密码子偏好性分析. 田春育,武自念,李贤松,李志勇. 2021

[2]珙桐叶绿体基因组同义密码子使用偏好性分析. 罗永坚,王茹,赵仁菲,卢新雄,尹广鹍,邓志军. 2024

[3]水杉叶绿体基因组同义密码子使用偏好性. 王茹,罗永坚,刘相泉,卢新雄,尹广鹍,邓志军. 2022

[4]基于高通量测序组装‘赤霞珠’叶绿体基因组及其特征分析. 谢海坤,焦健,樊秀彩,张颖,姜建福,孙海生,刘崇怀. 2017

[5]甘蔗野生种割手密叶绿体基因组特征及种内系统进化关系. 余熙恺,余泽怀,张清,张兴坦. 2023

[6]陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性的分析. 尚明照,刘方,华金平,王坤波. 2011

[7]茄腐镰孢(Fusarium solani)线粒体基因组密码子偏好性分析. 李秀璋,宋辉,李春杰. 2015

[8]油菜叶绿体基因组研究进展. 蔡梦鲜,闫贵欣,伍晓明,李俊,宋伟林. 2013

[9]利用叶绿体SSR标记研究甘蓝型油菜质基因组遗传多样性. 吕培军,伍晓明,许鲲,陈碧云,陆光远. 2009

[10]一株热自养甲烷杆菌的分离及鉴定. 仇天雷,承磊,张辉,邓宇. 2006

[11]七种微孢子虫核糖体小亚基基因(SSU rRNA)的克隆及其系统发育分析. 董世楠,朱峰,徐莉,沈中元. 2009

[12]一株苯胺降解菌的分离、鉴定及系统发育. 梁泉峰,陈明,徐玉泉,于海英,张维,平淑珍,陆伟,林敏. 2003

[13]茶园一株虫生真菌和宿主的分子鉴定与系统发育分析. 刘守安,韩宝瑜,江丽容,付建玉,周孝贵. 2008

[14]桑叶葡萄叶绿体基因组及其特征分析. 杨亚蒙,焦健,樊秀彩,张颖,姜建福,李民,刘崇怀. 2019

[15]三倍体茶树'西莲1号'叶绿体基因组特征及系统发育分析. 刘振,赵洋,杨培迪,成杨,唐怀廷,杨阳. 2023

[16]欧洲原始野生甘蓝的收集引进及其遗传多样性和群体遗传结构的分析. 许鲲,伍晓明,陆光远,陈碧云,高桂珍. 2009

[17]棉花叶绿体70 S核糖体S7蛋白基因的克隆和序列分析. 樊卫华,沈燕新,张中林,沈桂芳. 1997

[18]玉蜀黍属植物叶绿体基因组进化及变异研究. 马闯,贾民隆,王杰,彭丹,邢国芳,武志强. 2024

[19]甘蔗叶绿体基因组研究进展. 周会. 2013

[20]植物基因工程新途径:叶绿体转化. 苏宁,吴燕民,孙丙耀,沈桂芳. 2001

作者其他论文 更多>>