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基于SRAP标记的不同产区黄精的遗传多样性

文献类型: 中文期刊

作者: 李亚萍 1 ; 戴惠明 2 ; 姜武 3 ; 陈家栋 3 ; 段晓婧 3 ; 陶正明 1 ;

作者机构: 1.浙江农林大学食品与健康学院浙江省特色中药资源保护与创新利用重点实验室

2.永嘉县自然资源和规划局

3.浙江省亚热带作物研究所

关键词: 黄精;相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记;遗传多样性;产区

期刊名称: 浙江农林大学学报

ISSN: 2095-0756

年卷期: 2023 年 003 期

页码: 658-664

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】研究不同产区黄精Polygonatum spp.的遗传多样性,为其资源保护及品种选育提供更多理论依据。【方法】使用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记技术,分析来自华东(浙江、福建、安徽、江西)、西北(河北、陕西)、华中(湖南)、西南(四川、贵州、云南)等4个居群的47份黄精种质资源的遗传多样性。【结果】对88对SRAP引物进行筛选,有7对可用于黄精种质资源的SRAP-PCR分析,共得到159条扩增条带,其中多态性条带140条。物种水平上,多态性比率为88.05%,有效等位基因数(Ne)为1.600 6,Nei’s基因多样性指数(H)为0.204 1,Shannon信息指数(I)为0.308 0;居群水平上,多态性比率为42.14%~86.16%,H和I分别为0.188 1~0.259 1和0.238 2~0.399 4;4个居群的基因分化系数(Gst)为0.194 1,表明有80.59%的遗传变异在种群内进行,基因流(Nm)为2.075 4,表明居群间存在一定的基因流动;从非加权组平均法(UPGMA)聚类结果可知:当相似系数为0.66时,47份样品分成4组,Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ类的均为华东地区浙江种质资源,当相似系数为0.68时,Ⅱ类分成2支。西南与西北聚为一类,浙江庆元黄精聚类结果复杂,表明地理位置差异与亲缘关系远近没有特定关系。整体上华东居群遗传多样性丰富,而庆元黄精种质遗传多样性最丰富。【结论】黄精遗传多样性水平较高,居群间存在一定的基因交流,可为黄精新品种选育工作提供参考。图3表4参22

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